毕业论文和导师有矛盾吗

要看你的道歉真诚与否，导师有没有接受你的道歉，和导师的品性也有关。

毕业生和导师意见不和产生冲突是很常见的事情，但是这些事情上吃亏的往往是毕业生，因为导师负责毕业生的毕业作品和论文，他就有权不给通过或者给低分。一般在毕业生道歉以后，导师也就不计前嫌，但是还是要看导师的品性。

若是心胸宽广的导师，接受了毕业生的道歉，也就和以前一样，一视同仁；若是运气不好，遇见了心胸狭窄或者矛盾过大不愿意原谅的导师，那么毕业论文可能会很难通过，导师不但不给指导性建议还会处处挑刺。

导师

导师是高等学校或研究机关中指导他人学习、进修、或撰写学术论文的教师或科研人员。导师制由来已久，早在十四世纪，牛津大学就实行了导师制，其最大特点是师生关系密切。导师不仅要指导他们的学习，还要指导他们的生活。

导师制从制度上规定教师具有育人的责任，使教师在从事教学科研以外，将对学生进行思想、学习、科研、心理等方面的教育和指导作为其工作的另一部分。

以上参考百度百科-导师

其实没有什么影响，也不会进入档案。不会对找工作造成影响，毕业时仍然是应届毕业生。