现在纯生信圈内的人都知道，纯生信SCI不好发。当然这个也不是绝对的，需要看你选择了什么内容，内容比较新还是比较好发的，同时还需要看你会不会选择期刊，会选择期刊的结局自然就不一样。总的来说，纯生信比以前难发，特别是一些比较旧的套路，名声好一点的期刊都不要。因此，很多人又想做回老本行：meta分析。 真的可以做回meta分析吗？ meta分析本身就是有比较大争议的东西，有的人认为苹果与橘子可以直接合并，有的人则认为不能合并；有的人认为meta分析文章应该属于论著，而有的人则认为meta分析只能属于综述；现在有的单位承认meta分析，有的则将meta分析拉黑，发了meta分析就不能用来毕业、也不能用来评职称、报销课题经费等，也就是说发表了就等于白发表了。如果你医院还承认meta分析，或许还做能做回meta分析；如果不承认meta分析，你还愿意做回meta分析吗？ 总结： 想做实验，但是没有经费也没有实验条件，这条路显然走不通；想做预测模型，但是自己没有办法搞到临床数据，这条路也走不通；想做回meta分析，但是单位不承认meta分析，发表了也是等于无发，这条路更走不通。 其他的方法也不会，不做纯生信还能做什么呢?只要你争取拿到一些经费，补点简单的实验，生信还是比较好发的 。
临床预后模型，大多包含风险分层和独立预后分析两个验证分析，而很多文章在两个分析上存在不严谨。下面介绍一些分析的关键点。 一般而言，预后模型会有训练集和验证集，有一些还分为了训练集、验证集和测试集。首先，在有多个数据集的情况下，对于表达谱数据，需要进行批次校正；其次，如果仅有训练集和验证集（两个独立队列），cutoff不必保证相同，而如果有训练集、验证集和测试集（其中训练集和验证集是一个队列的拆分），训练集和验证集的cutoff需要保持一致，测试集的cutoff不强求。 很多文章都会在构建了prognostic scoring system的基础上，将临床病理性状纳入做单因素和多因素回归，也就是独立预后分析，有的还会基于多因素Cox模型构建nomogram，但事实是大多数文章的结果不可靠。我们知道Cox回归需要满足PH假定，而对PH假定的检验主要有LML曲线法、KM曲线法和Schoenfeld's 检验法。 对于分类数据，如性别、病理分级、组织学分期、有无突变等等，用LML曲线法和KM曲线法检验，若曲线互不相交、互相分离，则一般认为满足PH假定，可以纳入Cox模型；对于连续型变量，如年龄、构建的评分系统、肿瘤大小等等，最好使用三种方法都进行检验，其中Schoenfeld's 检验的p值需要>0.05，若p<0.05，则纳入该因素的结果是不可靠的。 网上有一些解决办法，如分层回归和时依回归，但这两种方法操作起来相对困难且结果不易解释。有一种比较简单的方法大家可以试一试，但仅针对于连续变量。可以将连续变量变为分类数据，如年龄分为>60和<=60岁，risk score分为高低风险组，此时再用LML和KM检验法进行验证。如果对于分类变量还不满足PH假定，那只能考虑剔除这个因素或者进行分层/时依回归了。 对于分期、分级这样的等级变量，很多文章直接将数据变为0、1、2、3等，这是严谨的。应该将该变量设置成哑变量，设置其中一个哑变量为参考组 (reference)，在数据科学中，称作热编码 (one-hot encoding)。 虽然以上分析比“不严谨”的方法操作起来多了一些步骤，但一旦被审稿人抓到把柄，返修起来将更加繁琐，所以还是一次做到位吧！
Medicine。Medicine这本期刊虽然好投，接收率极高，发文量极大，一年发文量达到5000多，是其他期刊几十倍甚至上百倍，愿意接收海量的纯生信数据挖掘和meta分析类文章。但是这本期刊的最重要缺点就是被一些单位科室拉黑了，也就是发表在该期刊上的文章不能用来评职称、毕业、不予经费支持，同时这本期刊还在预警期刊的名单上，处于高度预警等级，有很大被踢出SCI的风险。
不知道大家是否记得之前100多篇SCI论文大规模撤稿事件，这些作者基本都是国内临床医生、研究人员，撤稿的主要原因是伪造审稿人。 什么是伪造审稿人？ 在大规模撤稿事件之前，很多期刊都是在投稿的时候要求作者推荐1-3位审稿人，需要填写审稿人的姓名、单位、邮箱等资料。 其中，填写邮箱的时候就会存在漏洞，有些聪明的人就会抓住这个漏洞填写自己的邮箱，如果期刊主编发邮件来邀请审稿就变成自己评审自己的论文，自己评审自己的文章，结果肯定是接收出版的 。 发现这件事之后，很多期刊不再让投稿作者推荐审稿人了，因为很多期刊都知道这些漏洞，被作者搞一出伪造审稿人的事情出来。不过，现在有些期刊仍然会存在让作者推荐审稿人。 前几天就有人说：纯生信投稿时，期刊主编让推荐审稿人，不知怎么办？有些人第一时间就是想到自己的培训老师、外包公司的人等熟悉的人，这些肯定不行的，存在合作关系，非常容易被认为是伪造审稿人，一般这些培训老师是不愿意的，都是为了大家好 。 有些新手说既然不能找这些熟人，怎么样找审稿人呢？例如你写了纯生信投稿，你应该找一些相关发表了纯生信SCI论文的通讯作者，特别是国外的会好一些。有些期刊为了避免嫌疑，只能会让你推荐国外的审稿人。 不过，你推荐的审稿人一般期刊主编都不会用的，除非他们真的找不到人审稿才会使用，总的来说使用到的机会非常渺茫（自从发生因伪造审稿人大规模撤稿事件） 。
《预测》杂志主办：合肥工业大学预测与发展研究所周期：双月出版地：安徽省合肥市语种：中文;开本：大16开ISSN：1003-5192CN：34-1013/N邮发代号：26-46历史沿革：现用刊名：预测创刊时间：1982该刊被以下数据库收录：CSSCI中文社会科学引文索引（2012—2013）来源期刊（含扩展版）核心期刊：中文核心期刊(2011)中文核心期刊(2008)中文核心期刊(1992)
《胸》、《柳叶刀》。1、世界首个间质性肺病风险预测模型于国际著名医学杂志《胸》（CHEST，SCI收录，影响因子9.657在线发表上海交通大学医学院附属仁济医院风湿科鲍春德教授研究团队的最新研究成果：无肌病性皮肌炎相关间质性肺疾病的死亡风险预测模型。2、《柳叶刀》是国际上公认的最权威的综合性英文医学期刊之一，2022年8月《柳叶刀》在seminar研讨会专栏中，讨论了临床实践中最常见的间质性肺病。
Cover letter中文叫做投稿信，是在投稿的时候写给编辑的信，作用跟古时候拜访人家用的拜帖有点相似。如果把期刊编辑形容成住在高墙大院里的名门望族，那投稿人就是希望给伯乐相中的无名小辈，这么说来拜帖一定要精致醒目有特色。不过如果作者已经是业内大牛了，估计投稿信是可以随意一些的。
虽说文章能不能发表靠的还是科研价值本身，但是投稿信也是很重 要的。在现在发表的文章越来越多，权威期刊不缺稿源的情况下，责任编辑做的是择优录用，先淘汰掉一部分感觉上价值不大的稿件。如果投稿信没有含什么有用的信息，文章一眼看上去又没有太多吸引力，一些责任编辑就会很快做出拒稿决定。当然用的是非常委婉的说法，拒稿信用的也是统一模板。比如：
但是实际上，这篇第二天就被责任编辑拒稿的文章其实符合期刊发表的研究方向，因为有几篇相关的文章就是发表在该期刊上。不过被拒了也就拒了，再去辩解也毫无意义。不过好奇之下，还是去google了一下责任编辑的背景，主要是做光学的，跟文章所属的电磁方向虽然是一大类，但还是有所区别。再回头看那个投稿信，用的就是以前的模板，只是用两句话简要介绍了一下文章的主要结果。模板如下：
虽然投稿信也用两句话说明了一下文章结果的价值，但是在这种责任编辑只是大同行的情况下， 如果这两句话不能打动他，那么他就不一定能够认同文章的价值，就会直接作出拒稿的决定。
所以在重新投其他的期刊的时候，就意识到原先投稿信的分量还不够，还要加上一段文字说明为啥文章适合发表在该期刊上。上个月就有一个影响因子还不错的期刊的编辑给大家发了一个邮件，明确说明了，要是在投稿信里面没有加上这些文字，文章会被直接拒稿。
最能反映适合程度的当然是列出自己已经在该期刊上发表的文章，然后说明这两篇文章是有相关性的。如果没有过往记录呢，找出几篇该期刊最近2,3年发表的，被引用次数还不错的文章列举上去也是很有用的。5年前甚至10年前的就不要列了，因为现在期刊的scope都在不断地调整中，以前的热门方向，也许现在期刊已经看不上了。投稿信加上了这部分之后，重投了另外一个影响因子相当的期刊，文章很快被送审，很快给录用了。虽然不一定是投稿信带来的差异，但是还是愿意在心里认为投稿信也是要用心去写的。
不过也要记住，投稿信不要写得太长，最好在一页内把重要的东西说清楚。写得太长，编辑也会没有耐心看的。
有些人建议在投稿信中把推荐的审稿人也加上。这个视情况而定，如果期刊投稿的时候本身就要求填写几个推荐的审稿人，那么就不用占用投稿信的空间了。但是如果投稿系统没有这一项的话，那在投稿信加上会更好一些。提供的信息可以是审稿人的头衔、姓名、地址和电子邮件。记得多次确认一下，电子邮件是人家有效的而且是常用的。最後,若还是不放心, 可以请专业的论文润色公司如英论阁 提供协助
Cover Letter 既投稿信，对于科研论文新手来说，不知该如何下手，而对于论文老司机来说，重视程度普遍比较低。查尔斯沃思 论文润色 在往期的文章中多次介绍过投稿信的重要性（参见《投稿信的重要性》），投稿信可以告诉杂志及其编辑为什么他们应该考虑你的文章。这是特别重要的，因为当初审编辑在筛选你的论文时，就此决定是否在同行评审环节中寻找特定的专家，所以期刊欢迎增加对你研究的简要总结。 不同的期刊对投稿信的要求各不相同，例如有的杂志会要求推荐几位审稿人。一般会在杂志的作者指南（guide for authors）中看到具体的要求。许多作者并没有注意到投稿信的重要性，即便它的重要性已经成为常识问题。有些作者甚至对此有一些误解。 投稿信应包含哪些内容？这一问题在《投稿信的重要性》中已经有给出了详细的说明，在此再次强调一下，除了一些基本信息外，最主要的是把该篇论文的研究重点及学术贡献、创意简洁的强调下。 我们也为大家准备了一个通用模板，供作者参考，该模板来自SPIE： [Your Name] [Your Affiliation] [Your Address] [Date] Dear Dr. [Editor name], I/We wish to submit a new manuscript entitled “[title of article]” for consideration by the [journal name]. I/We confirm that this work is original and has not been published elsewhere nor is it currently under consideration for publication elsewhere. In this paper, I/we report on _______. This is significant because __________. The paper should be of interest to readers in the areas of __________. [Please explain in your own words the significance and novelty of the work, the problem that is being addressed, and why the manuscript belongs in this journal. Do not simply insert your abstract into your cover letter! Briefly describe the research you are reporting in your paper, why it is important, and why you think the readership of the journal would be interested in it.] Please address all correspondence concerning this manuscript to me at [email address]. Thank you for your consideration of this manuscript. Sincerely, [Yourname]
收件人：编辑邮箱主题：投稿《杂志名》【栏目】《你的文章题目》【笔名】附加：可以添加，用WORD就可以，里面要注明自己的联系方式正文：短篇的话附上全文最后注明你的笔名，联系方式电子邮件投稿要注意以下几点： 一、 电子邮件投稿应该用什么格式？ 主题：投稿栏目、文章名、发表笔名。 内容：文章的全部内容。 落款：您的真实联系地址、邮编、姓名、邮箱地址、固定电话、手机、QQ号码（注明QQ名）、其他您觉得有必要留的联系信息。 除了以上内容，一概不欢迎。 二、 为什么不欢迎使用附件？ （只发附件不行。如果正文与附件一起发则非常欢迎。） 大家知道，很多病毒是通过邮件附件传送的，就我知道，很多杂志社的电脑上都装了病毒粉碎机这个软件，就是说在处理电子邮件的时候，有附件的系统一律删除。这意味着您辛苦的文字永远不会被编辑看到。 另外，附件来稿格式不同，往往因为软件问题而打不开，或者，打开是乱码。 所以，为了您自身利益，别使用附件投稿。
邮箱格式是：登录名@主机名.域名。以QQ邮箱为例，QQ邮箱的格式为：qq号@qq.com。使用QQ邮箱投稿的操作方法参考如下：
1、打开QQ邮箱官网。
2、输入QQ账号密码进行登录。
3、在QQ邮箱主界面，点击左上角的写信。
4、在写信界面输入收件人的邮箱，以及填写好主题和正文后点击发送即可。
中国临床研究》杂志是由中华人民共和国新闻出版总署、正式批准公开发行的优秀学术期刊。要求预注册才能投稿
《预测》是双核心期刊，也就是北大中文核心期刊和南大核心期刊。你可以邮寄投稿，地址附后，或者直接到杂志社投稿。地址：合肥工业大学预测与发展研究所 邮编：230009期刊名称 预测 期刊CN号 34-1013/N 主管单位 教育部 主办单位 合肥工业大学预测与发展研究所 《预测》杂志由合肥工业大学预测与发展研究所主办，是国内唯一一份以预测经济、社会、科技发展，报道最新预测技术、方法及应用成果为主旨的学术期刊。自1982年创刊以来，一直以其独特的内容和学术风格深为广大读者所欢迎。1992年，本刊被评选为国家中文核心期刊。1998年，本刊被国家自然科学基金委员会管理科学部遴选和认定为17种中国管理科学重要期刊之一。同时，本刊还加入了《中国学术期刊（光盘版）》、《中国科学引文索引》（CSCI）、《中文社会科学引文索引》（CSSCI）“中国期刊网”等大型期刊数据库。
能发。
对一个医生来说，如果能提前预知患者是否会发生某种未知结局，那么临床工作会变得顺利很多，比如：
如果能够提前预测某恶性肿瘤患者对某种化疗药物耐药，那么就能提前避免使用该药物。
如果能够预测某个患者术中可能发生大出血，在手术前将准备的更加充分。
临床预测模型作为风险与获益评估的量化工具，可为医生、患者以及卫生行政人员的决策提供更为客观、准确的信息。也正因如此，临床预测模型相关的文章，往往能发表在较高分的SCI期刊中。
科学引文索引
《科学引文索引》（Science Citation Index,简称SCI）美国科学信息研究所（ISI）的尤金·加菲尔德（Eugene Garfield）于1957年在美国费城创办的引文数据库。SCI（科学引文索引）、EI（工程索引）、ISTP（科技会议录索引）是世界著名的三大科技文献检索系统，是国际公认的进行科学统计与科学评价的主要检索工具。
2020年2月，教育部、科技部印发了《关于规范高等学校SCI论文相关指标使用树立正确评价导向的若干意见》，该文件要破除论文“SCI至上”，也要以此为突破口，拿出针对性强、操作性强的实招硬招，破除“唯论文”，树立正确的评价导向。