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Falsediscoveryrate(FDR)，一般翻译为错误发现率。在研究使用假设检验解决机器学习中的分类问题时，我遇到了多重假设检验问题。FWER和FDR正是解决这一问题的两种方法。经过老师和师兄师姐的指导，我能够将FDR应用于自己的问题当中，并且实验结果
多重检验中的FDR错误控制方法与p-value的校正及原文地址：多重检验中的FDR错误控制方法与p-value的校正及Bonferroni校正作者：流泪鱼数据分析中常碰见多重检验问题(multipletesting).Benjamini于1995年提出一种方法,通过控制FDR(FalseDiscoveryRate...
多重检验校正总结：（1）当同一个数据集有n次（n>=2）假设检验时，要做多重假设检验校正（2）对于Bonferroni校正，是将p-value的cutoff除以n做校正，这样差异基因筛选的p-valuecutoff就更小了，从而使得结果更加严谨（3）FDR校正是对每个p-value做校正
p值在一次检测中，我们很大概率上可以排除出错的情况，但是如果检测次数非常大的时候，我们就无法控制出错的情况（如果10000次检测，则可能有10000*5%＝500次检测出错），这时候我们就需要多重假设检验来矫正错误，一种比较通用的方法就是FDR
在多重检验中提高判断标准的方法，我们就称之为多重检验校正。从1979年以来，统计学家提出了多种多重检验校正的方法。相应地，对p值校正之后的叫法也不一样，比如，FDR、Qvalue、Adjustedp-value，这个大家知道在多重检验时需要校正就行了，具体的用法作者有时间再教大家（这个作…
差异倍数(foldchange)foldchange翻译过来就是倍数变化，假设A基因表达值为1，B表达值为3，那么B的表达就是A的3倍。一般我们都用count、TPM或FPKM来衡量基因表达水平，所以基因表达值肯定是非负数，那么foldchange的取值就是(0,+∞).
9多重假设检验方法及其在经济计量中的应用.复杂数据主要表现在维数高、相依、非线性与不完全观测等，在基因序列、股市和社会经济等领域中经常出现。.传统的数理统计学方法在处理低维、、线性与完全数据时有效，但面对如此复杂的数据时，困难...
对于多重假设检验得到的P值需要进行校正。因为P值的阈值是人为规定的，无论是多小的P值，也仅仅能代表结果的低假阳性，而非保证结果为真。即使P值已经很小（比如0.05），也会被检验的总次数无限放大。比如检验10000次，得到假阳性结果的...
这是使用多重检验校正控制错误率后的结果。举个例子，当我们使用p<0.05为基准时，那么每20个基因，就可能有一个单纯因为概率被认为p<0.05，而当我们对上万个基因分析表达差异时，必须排除这种因为概率导致的假阳性，因此需要使用Bonferroni校正等方法控制falsediscoveryrate（FDR），并得…
怎么在Pearson’scorrelation得到falsediscoveryrate(FDR)值.利用R里面的cor.test(x,y),结果中会输出cor(也就是相关系数)和p-value，对于两个变量的p-value而言不用算fdr的，或者说，此时的p-value就是你拒绝原假设的fdr。.但在做了多个变量后得到了多个p-value后，可用p...
而针对诸如怎样同时检验成千上万个基因中哪些基因的表达水平有显著性差异之类的高维统计推断问题,以错误发现率FDR(FalseDiscoveryRate)为主要特征的多重假设...
多重检验问题是搞生物信息学时几乎绕不开的问题,笔者不是生物信息学出身(学计算机的),被FDR,p-value,q-value搞得晕头转向,听人家说这篇文章讲的比较清楚,所以耐...
如果检验一次,犯错的概率是5%;检测10000次,犯错的次数就是500次,即额外多出了500次差异的结论(即使实际没有差异)。为了控制假阳性的次数,于是我们需要对p值进...
针对微阵列数据的多重检验问题,可通过控制FDR来筛选差异基因/位点。假设挑选了R个差异表达的基因,其中有S个是真正有差异表达的,另外有V个其实是没有差异表达的...
太重要了,对于大数据时代的统计而言。一般情况下:我们可以认为Qvalue=FDR=adjustedpvalue,即三者是一个东西,虽然有些定义上的细微区别,但是问题也不大...
利用总结的FWER和FDR的控制过程对P值进行调整,给出不同控制过程下的显著影响指标。通过传统的统计分析方法和多重假设检验方法得出的结论作对比。结果显示,多重假设检验方法在...
在A/B实验设计——如何避免多重检验错误中,介绍了什么是多重检验,并且介绍了Bonferronicorrection、Holm–Bonferronimethod。本篇将更深入讨论应对多重检验的...
多重检验中的FDR错误控制方法与p-value的校正及Bonferroni校正数据分析中常碰见多重检验问题(multipletesting).Benjamini于1995年提出一种方法,通过控制FDR(FalseDisco...
最近看到多重检验控制方法FDR（FalseDiscoveryRate），看不大懂，请教论坛牛人1、有没有什么教材上讲...
2011年中国卫生统计学年会论文集综述多重检验假设中假阳性错误率FDR的控制与估计方法。哈尔滨医科大学]!生统计学教研室近年米,基因组学、蛋白组学利代谢组学...