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【摘要】：多序列比对是生物信息学中至关重要的一步。传统的序列比对的方法是NP难问题。目前的算法都是以牺牲某种程度的精度为代价,达到可实用的速度。由于现有的蛋白质多序列比对算法难以兼顾速度和精度,因而在基于氨基酸多序列比对算法的蛋白质进化演化研究中,也不可避免的存在着计算...
多序列列线可被视为诱变遗传学试验中的自然突变状况，其对序列上单一位点变异的分析的确提供了该位点在蛋白质三级结构中的信息；二是神经网络已开始被用于根据序列预测结构。.目前已有这样一个共识，即在有大量、高质量的多序列列线结果的情况下...
本文的主要内容如下：在第一章，根据DNA序列中四种核苷酸A、G、C和T的大连理工大学博士学位论文tDNA序列及蛋白质序列的分析与比较化学结构分类，提出DNA序列的特征序列的概念．利用特征序列中每种（o，i）三元组出现的频率，构造出一种压缩矩阵...
【陪你学·生信】九、多序列比对-MultipleSequenceAlignment（MSA）一、多序列比对能干嘛？下面是多序列比对的主要应用：1.推测——Extrapolation可以推测一条未知的aa序列属于某个已知的蛋白质家族或者拥有相似蛋白质结构域甚至相似的蛋白
中国农业大学博士学位论文生物信息学中的序列比对算法研究姓名：唐玉荣申请学位级别：博士专业：农业电气化与自动化指导教师：汪懋华20040601中国农业大学博士学位论文摘要摘要序列比对是生物信息学中一种基本的信息处理方法，对于发现核酸和蛋白质序列上的功能、结构和进化的...
多序列比对及蛋白质功能及结构预测.关键词：多序列比对蛋白质.如果序列重叠群(contig)包含有蛋白质编码区，则接下来的分析任务是确定表达产物–蛋白质的功能。.蛋白质的许多特性可直接从序列上分析获得，如疏水性，它可以用于预测序列是否跨膜螺旋...
博士毕业论文—《基于隐马尔可夫模型的蛋白质多序列比对方法研究》摘要第1-6页ABSTRACT第6-15页第1章绪论第15-35页1.1课题背景及研究的目的和意义
对于蛋白序列，BLAT是用来设计寻找80%及以上相似至少20个氨基酸的序列。相比于BLAST，BLAT比对更简单方便，速度更快，还可以输出更为易读的比对结果，可以很容易的找到exons和introns。BLAT也同样可以处理DNA，RNA和蛋白质序列的比对。
如何做出漂亮的序列比对图——ENDscript/ESPriptFirstrelease：2017-12-16Lastupdate:2018-03-17大家经常在文献中看到非常好看的序列比对图，现在笔者将目前见过的最好看的序列比对图的作图方法作分享，希望对大家的科研工作有所帮助，效果图如下：
打开页面，上面有全局比对工具、局部比对工具、还有基因组比对工具。首先看全局比对中的蛋白质序列比对工具（图2.31）。输入值非常简单，把要比较的两条蛋白质序列贴在输入框里或者上传。如果想要进一步设置比对的参数，可以点Moreoptions。
目前，构建多序列比对模型的方法大体可以分为两大类。第一类是基于氨基酸残基的相似性，如物化性质、残基之间的可突变性等。另一类方法则主要利用蛋白质分子的二级结构和三级...
文档格式:.pdf文档页数:58页文档大小:2.55M文档热度:文档分类:论文--大学论文文档标签:评估研究算法多序列蛋白质算法与以及蛋白比对算法...
Proteinsequencealignmentdeterminingevolutionaryrelationshipsbiologicalfunction.Thispaperintroducessomeproteinsequencealignmentmethodswhic...
比对论文:基于谱的蛋白质序列比对方法研究比对蛋白质序列精确度论文比对论文:基于谱的蛋白质序列比对方法研究【中文摘要】随着生物信息学的发展,大量的蛋白质...
蛋白质的许多特性可直接从序列上分析获得,如疏水性,它可以用于预测序列是否跨膜螺旋(transmenbranehelix)或是前导序列(leadersequence)。但是,总的来说,我们根据序列预测蛋白质功能的唯一方法...
内容提示:大连理工大学博士学位论文DNA序列及蛋白质序列的分析与比较姓名:贺平安申请学位级别:博士专业:计算数学指导教师:王军20030301摘要DNA、RNA和蛋...
我目前得到大量微生物同一基因的的DNA序列,可以直接对DNA序列进行比对,得到进化关系,我发现DNA序列存在着差异,同时我想进一步利用DNA序列进行相关蛋白质的序列比对.因为考虑...
比对论文:基于谱的蛋白质序列比对方法研究【中文摘要】随着生物信息学的发展,大量的蛋白质需要进行分析。但对于许多蛋白质序列,人类并不清楚它们之间的进化关系...
DNA序列的特征序列推广到蛋白质序列中.根据20种氨基酸的物理化学性质,给出一种蛋白质序列的特征序列的概念来表示氨基酸的疏水性质和电价性质,并给出蛋白质序列...
多序列比对是生物信息学中至关重要的一步.传统的序列比对的方法是NP难问题.目前的算法都是以牺牲某种程度的精度为代价,达到可实用的速度.由于现有的蛋白质多序列比对算法难以...