今天跟大家介绍两个数据库:NCBI和uniprot。一般在想要了解某个蛋白信息的时候都是从这两个数据库开始查找。NCBI(NationalCenterforBiotechnologyInformation,美国国家生物技术信息中心)不用多说,光名字就…
一、应用场景需要表达某物种的特定蛋白或基因二、序列获取方法:1.打开NCBI网站(https://ncbi.nlm.nih.gov)2.点击下图红色箭头指示的下拉框3.找到下图所示的“Gene”4.选中“Gene”,在右边的搜索…
上面有各种物种(包括植物)的蛋白详细信息,包括序列,结构,功能介绍,详细的annotation和分类,甚至列了很多相关publication参考文献(当然很多时候不全,需要另外查询,但可以参考,有一些列出来的文献自己找还未必能找到),最后还有一个protein
2011-04-20怎样在NCBI上搜索基因序列或者是蛋白质序列?102015-02-16怎样用blast找到蛋白的相关文献12014-08-22请问,已知蛋白序列的GI号,怎样在NCBI中查找对应蛋白的序...52013-12-02如何在Genbank上查找某一生物表达特定蛋白的一段基因序列12...
以CD28蛋白序列为例(uniprot有序列),打开CBS-SignalP,fasta格式输入:结果显示,该序列含有信号肽,且切割位置位于18-19位氨基酸—意味着信号肽位于1-18位,与前面查询结果完全一致;含有信号肽意味着序列可能是分泌蛋白,也可能是I型跨膜蛋白,下面再分析下跨膜区同样以fasta格式预测CBS-TMHMM...
蛋白序列模糊查找工具.-SMS2南京德泰生物镜像.蛋白序列模糊查找工具按照类似BLAST的方法在目标序列中搜索相似的子串,并按照相似度从高到低返回相似子串。.输入原始序列或者FASTA格式序列,长度限定在2000以内。.输入需要模糊查找的子串,长度限定在30...
NCBI里有蛋白序列就肯定可以查到对应的基因序列.例子如下:.myosincrossreactiveantigen[Bifidobacteriumbreve]GenBank:ADY18551.1.在NCBI的页面里,可以看到以下内容:.LOCUSADY18551625aalinearBCT05-MAR-2011.DEFINITIONmyosincrossreactiveantigen,partial[Bifidobacteriumbreve].ACCESSIONADY18551.
2016-10-07求大神指教蛋白质的氨基酸序列怎么排序啊!82008-12-13请教:怎么用NCBI查询新城疫病毒F基因的蛋白质序列、氨基酸...212019-04-04如何确定参与参与蛋白质相互作用的氨基酸序列2016-09-27如何从蛋白质的氨基酸序列计算其分子式2...
为此,本实验以细胞色素c的蛋白质序列为实验对象,以计算机为平台,以DNAstar、SeqVerter、Cn3D、RasMol等当前分子生物学研究软件为工具。.通过本实验弄清楚了蛋白质的结构,这对进而理解其结构与功能的关系以及空间结构具有重要意义。.并通过本实验研究...
如何查找连续的mRNA、cDNA、蛋白序列运用STS查找已经公布的引物序列如何运用BLAST进行序列比对、检验引物特异性今天我们就先讲第一部分:如何查找基因序列、mRNA、Promoter。这里主要用到的是Mapviewer,我们以人的IL6(白细胞介素6...
文献、核酸序列、蛋白质序列查询常用使用技巧•多添加关键词可以减少搜出的文献数量•作者+关键词是一种好办法•作者的名字:FerryJG•使用好Advanced•邮件通知可以将某一...
首先你需要先在NCBI里查你所研究的蛋白会搜索出很多相关的结果,根据你所查的蛋白氨基酸数量选择相应的结果,如会出现一些信息,Authors、Litle、Journal等就可... .new-pmd.c-abstractbr{display:none;}更多关于蛋白序列查找论文的问题>>
一个蛋白是一个异二聚体,但是在NCBI上有一个亚基是写的subunit,而另一个却没有写直接写的的是...
单项选择题利用中国知网文献数据库(中国知网)查找论文题目是“扩张蛋白家族蛋白序列分析”发表在期刊“生物信息学”2008年第7卷第3期上()。点击查看答案进入题...
蛋白质序列二级结构搜索.ppt,蛋白质序列二级结构的搜索Abstract生命科学家使用的生物数据集的查询工具效率低下在基于二级结构的大型数据集上搜索的问题定义...
硕士学位论文摘要摘要蛋白质序列库搜索方法为液相.串联质谱联用仪产生的高通量质谱数据提供了快速的分析方式,使生物样品中的蛋白质可以得到快速定性定量分析...
下载相应的基因组文件,里面有蛋白序列。如下图所示,ensemble上的拟南芥基因组上有相应的蛋白序列。
比对蛋白序列精确度论文.doc,比对论文:基于谱的蛋白质序列比对方法研究【中文摘要】随着生物信息学的发展,大量的蛋白质需要进行分析。但对于许多蛋白质序列,...
固定长序列片段为912当或0个连续氨基酸残基时,0交叉检验1平均预测精度能达到8~8,c—nf验平均预测精度能达到7~23jkkiae检47.6关键词:...
内容提示:大连理工大学博士学位论文DNA序列及蛋白质序列的分析与比较姓名:贺平安申请学位级别:博士专业:计算数学指导教师:王军20030301摘要DNA、RNA和蛋...