分子动力学模拟的计算及应用所谓分子动力学模拟是利用计算机技术来模拟或已有的理论知识，进一步来分析微观方面分子或原子的运动。随着人们对牛顿力学的不断研究，进一步从原子物理和统计物理的角度来从微观方面分析宏观的问题。目前所具有的配置
一篇很好的分子动力学模拟博士论文-分子模拟-LAMMPS/DL_POLY-小木虫论坛-学术科研互动平台.客户端APP下载.考博/论文辅导.登录注册.帖子.帖子.用户.本版.应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。.
毕业论文关键词：纯铁；分子动力学模拟；相变MoleculardynamicssimulationofphasetransitioninpureironAbstract：Basedonthesecondnewton’slaw,moleculardynamicsimulationhasbeenwidelyusedintheresearchofmaterials,especiallyinfieldofnano-materials.
我们采用分子动力学模拟研个非肽小分子抑制剂和MDM2蛋白的结合。MM-PBSA方法计算的绝对结合自由能与实验确定的非常一致。研究表明，范德华能量是结合抑制剂的最大的结合能成分，这表明对这些抑制剂结合MDM2蛋白主要是形状的互补。
要:采用分子动力学模拟方法，本论文对铁-碳合金中不同碳浓度下的奥氏体-马氏体相变进行了研究.我们首先对用于描述铁原子间相互作用的MEYER-ENTEL势进行了测试，通过对晶格常数、原子间结合能、体量等材料基本特性进行了测试并与理论值进行了对比。
分子动力学诱导拟合利用全原子模拟来增加或减少活性位点口袋的大小。诱导结合的配体的初始姿势能够通过将已知抑制剂对接到靶蛋白的口袋获得。可以在较低浓度配体存在的情况下进行MD模拟，其已被证实能够有效地探测构象空间和发现新的隐蔽口袋，随后进行实验验证。
图1使用分子动力学模拟发表的SCI论文数分子动力学是一门结合物理，数学和化学的综合技术。分子动力学是一套分子模拟方法，该方法主要依靠牛顿力学来模拟分子体系的运动，以在由分子体系的不同状态构成的系统中抽取样本，从而计算体系的构型积分，并以构型积分的结果为基础进一步计算...
分子动力学诱导拟合利用全原子模拟来增加或减少活性位点口袋的大小。诱导结合的配体的初始姿势能够通过将已知抑制剂对接到靶蛋白的口袋获得。可以在较低浓度配体存在的情况下进行MD模拟，其已被证实能够有效地探测构象空间和发现新的隐蔽口袋，随后进行实验验证。
压力对小分子气体在液压油中扩散行为影响的分子动力学研究（上海海事大学商船学院，上海201306）要：采用分子动力学方法模拟研究了不同压力下小分子气体在液压油中的扩散。.模拟过程中均选用PCFF力场，首先对模拟体系进行NPT下500ps时间的动力学优化...
分子动力学模拟Pb纳米薄膜的结合能和晶格参数的尺寸效应来源期刊：材料导报2006年第8期论文作者：齐卫宏关键词：Pb薄膜;结合能;晶格参数;尺寸效应;摘要：利用MaterialsExplorer分子动力学软件包,模拟研究了尺寸为0.5～15nm的Pb纳米薄膜的结合能和晶格参数的尺寸效应.研究表明,Pb纳米薄膜的...
分子动力学是一门结合物理,数学和化学的综合学科技术,物理或者化学方向从业者在晋升职称时也会发表分子动力学论文,但是这类作者缺乏相关的经验,不知道要如何发表,为此期刊之家小编也...
一篇很好的分子动力学模拟博士论文，与大家分享。
文档格式:.pdf文档页数:24页文档大小:1.64M文档热度:文档分类:论文--论文指导/设计文档标签:MD分子动力学研究毕业论文系统标签:空位动力学研究分子...
内容提示:中国科学技术大学博士学位论文铜缺陷熔化及其冲击力学行为的分子动力学模拟姓名:韩立波申请学位级别:博士专业:固体地球物理指导教师:傅容珊;罗...
分子动力学模拟方法能够模拟分子的运动状态,成为研究分子间相互作用的一种重要方法,近年来,随着计算机技术的发展,使得分子动力学模拟这种较为真实和直观的\...
能量最小化是优化模拟系统的重要过程,共轭梯度和最陡下降算法是能量最小化的常用算法,其目的是降低系统构建过程中产生的不合理构象,并且使系统能量达到极小...
《第十次中国生物物理学术大会论文摘要集》2006年收藏|手机打开用分子动力学模拟研究小蛋白Chignolin的构象熵刘贵忠王吉华窦相华于家峰【摘要】:正Chignolin是人工...
「原创」AlAin大学Ghattas小组JCIM论文：分子动力学模拟探究小分子化合物的聚集如何导致假阳性药物前期开发过程中，使用酶活抑制实验技术筛选化合物库经常会出现假阳性结果。据统计...
小分子水簇与蛋白质相互作用的分子动力学研究MDsimulationresearchoninterationsbetweenwaterclustersandprotein学科专业:化学工程研究生:王运芬指导教师:...
基于蛋白质和小分子热力学和动力学的计算方法和预测热力学和动力学的重要性,本论文的研究内容主要有以下五个部分。本论文第一章详述了蛋白质和小分子相互作用的重要性,从蛋白...