日期：导师签名：日期：辽宁石油化工大学硕士学位论文本论文在综述了前人通过分子模拟方法进行的工作的基础上，系统研究了噻吩在NaY分子筛上的吸附过程，同时进行了氨分子能量的退火计算，开展了如下具有创新性的研究工作：建立指定硅铝比且随机
分子动力学是一个交叉学科，需要掌握很多内容，下面大致整理了一些。.力场：任何计算都要用到，所以最好能够熟悉一些常见的力场模型；.系综：这个东西可以说很复杂，需要学习统计力学，如果掌握对于计算过程会理解更透彻。.bash：如果能编写一些简单...
今天给大家介绍2020年12月22日在arXiv上发表的预印本“TorchMD:Adeeplearningframeworkformolecularsimulations”，该文章的通讯作者是西班牙庞培法布拉大学的GianniDeFabritiis教授。.文章中提出了”TorchMD“，一个混合经典和机器学习势的分子模拟的框架。.文章中所有的力...
分子动力学模拟心得适合新手1.看完《分子模拟从算法到应用》那本书的第四章，不用全看完，但是至少要对分子动力学模拟过程有一个了解。2.试着按照书的过程做个Ar的NVE，其实Ar和离子晶体以及其它的任何材料的差别仅仅是势函数的问题，虽然由势函数带来了一些问题，但是这些都不是本质...
快速入门用MaterialStudio，Tersoff势，鼠标点点就能做。做得好不好全凭自己个儿的人品了。故事细节：前年我的同事带一个本科生毕业论文，学生已经找好了工作要实习，干活时间太缺乏，就派他用金坷垃（划掉）Lennard-Jones势拟合了点参数，放到...
在分子动力学模拟中，常用采用RMSD来快速判断某段轨迹是否达到平衡，以便进行后续模拟或分析。.RMSD的高度反映了轨迹相对于参照分子（通常选取轨迹第一帧，即初始状态）的整体偏离程度；但这不是至关重要的因素，因为采用不同的参照帧，高度和形状都会...
分子模拟教程(径向分布函数)详解.ppt,掌握分子模拟方法的必备知识：编程技能(FortranorC/C++)统计物理学（统计力学）：统计物理学基础；系综原理；非平衡统计力学基础；涨落理论分子热力学：分子间相互作用理论；分布函数理论气体分子运动论其它什么是计算机分子模拟方法？
本课程介绍计算化学领域的基础知识与应用，即基于量子化学和分子力学方法对研究原子和分子性质以及化学反应途径、结构与性质关系等，在结构化学基础上，进一步对计算化学理论知识和实践进行学习，它起到了计算化学入门的作用。
分子动力学（MolecularDynamics，MD）模拟是一套分子模拟方法，是研究凝聚态系统的有力工具。通过分子动力学模拟，研究者得到体系原子的运动轨迹，可观察到原子运动过程的各种微观细节。通过对研究体系的动态模拟，我们能够在分子水平上理解生物大…
分子模拟论坛(又称模拟小窝，计算模拟论坛）旨在传播分子模拟的知识和技能、学习经验等；讨论分子动力学,量子化学等模拟方法以及高性能并行计算技术在计算物理、计算化学、计算材料科学,药物设计等领域的发展与应用。
在指导过程中,指导教师的主要精力应该集中在前期的选题,中期的解决问题,以及后期对学生论文的修改.分子模拟是在实验基础上,通过基本原理,构筑起一套模型和算法,从而计算出合...