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从原子到大分子体系的计算机模拟——计算化学50年EnricoClementi1GiorginaCorongiu2帅志刚3马忠云3张天3尚远31.ViaCarloni38,22100Como,Italy2.DipartimentodiScienzeChimicheeAmbientali,Universitàdell'Insubria3.
通过计算模拟研究PPI的结构和功能,并设计新型的小分子先导物具有重要意义。本文对两种不同的蛋白-蛋白相互作用进行了计算机模拟,研究了影响相互作用的关键氨基酸残基;同时,通过生物电子等排体原理设计了一种新型的靶向p62-zz结构域的自噬抑制剂。
并利用分子动力学模拟方法计算了融化温度、内能、熵、焓等热物理学量，根据模拟结果还绘制了均方根位移图，为研究纳米团簇提供了定量而准确的数4.2在金属元素中的应用Yang[29]研究了金属金的凝固行为，选用的EAM数，模拟结果显示金属的最终结构
服务内容4:分子动力学模拟蛋白结构优化、结合自由能计算等通过分子动力学等方法,模拟蛋白,DNA及RNA等分子在不同温度,PH值,电压等各种条件下结构变化,预测不同分子间结合自由能,分析药物结合大分子后对其二级结构的影响,从而多角度阐述生物结构变化所导致的变化状况,阐明人体生物致病等生物...
浅谈计算机模拟技术在材料科学中的应用论文现代高新技术的发展,对材料的性能要求越来越高,由此对材料科学本身也提出了更高的要求.对材料微观结构与宏观性能关系了解的日益深入,人们将可以从理论上预言具有特定结构与功能的材料体系,设计出符合要求的新型材料,并通过先进工艺和技术制造...
ZnO材料的理论模拟计算毕业论文.本文采用基于密度泛函理论的第一性原理模拟计算方法，并结合平面波赝势方法，运用VASP软件包首先分为四个步骤优化了ZnO材料结构：(1)截断能的优化；(2)SIGMA的优化；(3)K格点的优化；(4)晶格常数的优化。.为了优化原子...
分子力学，又叫力场方法（forcefieldmethod），目前广泛地用于计算分子的构象和能量。分子力学从本质上说上是能量最小值方法，即在原子间相互作用势的作用下,通过改变粒子分布的几何位型,以能量最小为判据,从而获得体系的最佳结构。
计算材料学主要包括两个方面的内容：一方面是计算模拟，即从实验数据出发，通过建立数学模型及数值计算，模拟实际过程；另一方面是材料的计算机设计，即直接通过理论模型和计算，预测或设计材料结构与性能。前者使材料研究不是停留在...
不请自来，简要回答一下。我们知道，传统经验力场的方法模拟体系较大，速度也比较快，但是模拟的精度取决于经验力场的设定；基于第一性原理的计算方法计算精度高但随之而来的就是高昂的计算代价，受限于当前算力，基于第一性原理的计算方法可计算的体系一般而言都不会很大。
基于分子模拟的二氧化硅介电常数温度特性规律的研究.文章编号:049026756(2005)0z220094205收稿日期5223作者简介,男,博士研究生,xjx(西安交通大学电力设备电气绝缘国家重点实验室,西安710049)摘要:作者将分子模拟技术应用于材料介电性能研究中,以了解介电常数...
在指导过程中,指导教师的主要精力应该集中在前期的选题,中期的解决问题,以及后期对学生论文的修改.分子模拟是在实验基础上,通过基本原理,构筑起一套模型和算法,从而计算出合...
过去十年来,计算能力大幅增长,使得计算机方法能够加速药物发现过程。分子动力学模拟,在基于结构的药物设计、探索蛋白质的能量和鉴定其生理构象方面尤其有价值,这个系列主要讲述MD模...
北京工业大学硕士学位论文分子动力学模拟与自由能计算在药物分子设计中的应用姓名:薛颖申请学位级别:硕士专业:流体力学指导教师:王存新2003.5.1分子动力...
中国硕士学位论文全文数据库前2条1王慧;CF/PPEK复合材料界面微观结构的分子模拟[D];哈尔滨工业大学;2006年2李丽娜;计算机辅助HIV-1与戈谢病抑制剂分子设计研究[D];兰州大学...
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《化学图文设计与分子模拟计算》可作为化学及相关专业高年级本科生、研究生的教材和化学专业教师及有关研究人员的参考书,也可作为相关软件的使用参考书。化学图文设计与分子模拟计算...