基于氨基酸理化性质和位置特征的蛋白质序列比较及其应用.于璐璐.【摘要】:计算机技术和高通量生物实验技术的大力发展使得生物信息学迅猛发展,大量生物分子序列被获得。.如何有效地从这些生物分子序列中提取信息,研究序列之间的关系,是揭示生命发展...
从COBALT序列比对的结果,可以看出其中有条序列(XP_511495)跟其它序列的差别很大,使整个比对的结果多了好多Gap,并且打断了可能的蛋白结构域。XP_511495是一个预测的序列,这样的序列对序列比对是没有任何参考作用的,反而对比对的结果造成影响。
2019-05-31如何做DNA序列和氨基酸序列一一对应的图?12018-11-16如何利用DNAMAN进行多序列比对的同时比对氨基酸(如图)2015-05-04如何用clustalx做序列同源比对后的结果图2017-09-15如何用mega做多重序列比对分析2020-03-22MEGA6中如何将比对的氨基酸序列的每行个数设成一致?
大连理工大学博士学位论文:DNA序列及蛋白质序列的分析与比较下面简单介绍一下序列比对算法:1.序列比对:这里只介绍DNA序列的比较.对于每一个DNA序列,我们都能把它看作是一个在四个字母的字母表={A,C,G,T}上的字.首先,我们把这个字母表扩充...
对于蛋白序列,BLAT是用来设计寻找80%及以上相似至少20个氨基酸的序列。相比于BLAST,BLAT比对更简单方便,速度更快,还可以输出更为易读的比对结果,可以很容易的找到exons和introns。BLAT也同样可以处理DNA,RNA和蛋白质序列的比对。
DNAMAN是美国LynnonBiosoft公司开发的高度集成化的分子生物学综合应用软件,可以用于多序列比对、PCR引物设计、限制性酶切分析、质粒绘图、蛋白质分析等,几乎囊括了所有日常核酸、蛋白质序列的分析工作。因此掌握它,是从事分子生物学工作的...
多氨基酸序列比对图,可以用什么软件做?.作者郭瑞坚001.来源:小木虫4008帖子.+关注.如题,我现在有几条氨基酸序列,要做一下比对的图,因为见别人论文里有很多做的,但是我不会做。.下面我传了一个别人文章里的截图,希望知道的同学可以告诉...
蛋白序列相似度比对可以得到蛋白相似度信息,以及分析同源蛋白在进化过程中的序列保守型,预测可能存在蛋白结构域。获得蛋白序列氨基酸序列的获取可以直接通过cDNA翻译,也可以直接从Uniport上直接获取氨基酸序列。以拟南芥中FLS家族中的...
2楼:Originallypostedbyhl16010921at2013-09-1211:49:19.常用的是bioedit,可以比对核酸和蛋白序列。.软件和教程都很好搜到。.你试试看.谢谢,好像可以!.我试了下,但是我不会做一些标记,比如用框把一些结合位点的氨基酸圈起来,或者在氨基酸下面标写星号,你...
氨基酸组成成分方法没有考虑残基在序列中出现的顺序,而仅仅计算二十种基本氨基酸在序列中的出现频率,该模型忽略了氨基酸残基间的顺序关系;k-mer频度的特征提取方法仅考虑了氨基酸残基的局部顺序关系,当k增加时,向量维度迅速升高;这两种模型
我最近在学氨基酸多序列的比对,不知道哪位大神就上面那副图可以详细描述一下,万分感谢发自小木虫...
多序列比对在分子生物学中是一个基本方法,用来发现特征序列,进行蛋白分类,证明序列间的同源性,帮助预测新序列二级结构与三级结构,确定PCR引物,以及在分子进... .new-pmd.c-abstractbr{display:none;}更多关于氨基酸序列比较论文的问题>>
第27卷第5期2013年1O月长治医学院学报JOURNALOFCHANGZHIMEDICALCOLLEGEVo1.27No.5Oct.201332539种动物HMGB1氨基酸序列比对分析刘明社...
丁香园论坛论文写作投稿帖子详情MegAlign比对氨基酸核苷酸序列,怎么能只显示差异部分浏览624·讨论1右手画彩虹楼主发布于2019-09-26来自iPhone/iPad客户...
华中农业大学2011届硕士研究生学位论文4610NPRS片段编码氨基酸序列比对结果FigurealignmentresultsputativeaminoacidsequencesamplifiedNRPSfragments...
中国重要会议论文全文数据库前4条1靳利霞;唐焕文;;氨基酸序列的数学描述[A];第九次全国生物物理大会学术会议论文摘要集[C];2002年2杨靖清;王晨;杨琦;史新昌;裴德宁;饶...
现在MIT把AI的预测能力又推进了一步,直接通过氨基酸序列预测蛋白质分子的生物学功能,跳过AlphaFold预测蛋白质立体结构的步骤。他们的论文《Learningproteinsequenceembeddingsu...
研究表明,当被比较的氨基酸序列的亲缘关系比较近时(相同率>0畅8),采用上述几种方法得到的氨基酸替代距离几乎相同,但随着被比较氨基酸序列的亲缘关系变远,...
BLAST核酸/氨基酸序列相似性比较Blast(BasicLocalAlignmentSearchTool)是一套在蛋白质数据库或DNA数据库中进行相似性比较的分析工具。BLAST程序能迅速...
《第二十二届中国控制会议论文集(下)》2003年收藏|手机打开氨基酸序列编码对蛋白质二级结构预测的影响孙海军阮晓钢【摘要】:本文主要通过运用前向型BP神经网络来比较...