你完全可以在上海的浦东代办处交费，也可以在代办处递交申请文件。至于资助的问题，不知道上海的具体规定，如果规定要在当地代办处递交的专利才能给于资肋的话，那你在北京递交的专利就不能得到当地的资助。你是不是有二个专利？我没有看明白。如果是一个专利递交了二次申请费，是可以退费的，但要等较长的时间，国家知识产权局一般会把多交的费或退给你或进入你的专利（如果你的专利授权了的话）其它费用里，不足部分要你补交。至于退费，不会有什么时间限制。
退款请求人只能是缴款人，申请人（或专利权人）、代理机构作为非缴款人请求退款的，应当声明是受缴款人委托办理退款手续。1、请求退款应当书面提出，说明理由并附具相应证明。例如，中国专利局开出的费用收据复印件、邮局或者银行出具的汇款凭证等。提供邮局或者银行的证明应当是原件，不能提供原件的，应当提供经出具部门加盖公章确认的或经公证的复印件。 2、提交《意见陈述书（关于费用）》。退款请求应当注明申请号(或专利号) 和要求退款的款项的信息(如票据号、费用金额等) 及收款人信息。当事人要求通过邮局退款的，收款人信息包括姓名、地址和邮政编码；当事人要求通过银行退款的，收款人信息包括姓名或者名称、开户行、账号等信息。 3、相关材料邮寄地址：北京市海淀区蓟门桥西土城路6号国家知识产权局专利局受理处。邮编：100088。注意：被退的款项视为自始未缴纳。
申请办理专利退款手续如下：1、请求退款应当书面提出，说明理由并附具相应证明。例如，中国专利局开出的费用收据复印件、邮局或者银行出具的汇款凭证等。提供邮局或者银行的证明应当是原件，不能提供原件的，应当提供经出具部门加盖公章确认的或经公证的复印件；2、提交《意见陈述书（关于费用）》。退款请求应当注明申请号或专利号和要求退款的款项的信息（如票据号、费用金额等）及收款人信息。当事人要求通过邮局退款的，收款人信息包括姓名、地址和邮政编码；当事人要求通过银行退款的，收款人信息包括姓名或者名称、开户行、账号等信息。退款请求人只能是缴款人，申请人（或专利权人）、代理机构作为非缴款人请求退款的，应当声明是受缴款人委托办理退款手续。专利的特点如下：1、具有独占性。也称垄断性或专有性、排他性，专利专属权利人所有，专利权人对其权利的客体（即发明创造）享有占有、使用、收益和处分的权利；2、具有时间性。所谓专利权的时间性，即指专利权具有一定的时间限制，也就是法律规定的保护期限。期限届满后，专利权人对其发明创造就不再享有专有权。原来受法律保护得发明创造就成了社会的公共财富，任何单位或个人都可以无偿使用；3、具有地域性。所谓地域性，就是对专利权的空间限制。它是指一个国家或一个地区所授予和保护的专利权仅在该国或地区的范围内有效，对其他国家和地区不发生法律效力，其专利权是不被确认与保护的，只有以一定地域内的法律才得以产生并在该地域内受到法律保护《中华人民共和国专利法》第二条 本法所称的发明创造是指发明、实用新型和外观设计。发明，是指对产品、方法或者其改进所提出的新的技术方案。实用新型，是指对产品的形状、构造或者其结合所提出的适于实用的新的技术方案。外观设计，是指对产品的整体或者局部的形状、图案或者其结合以及色彩与形状、图案的结合所作出的富有美感并适于工业应用的新设计。第四十二条 发明专利权的期限为二十年，实用新型专利权的期限为十年，外观设计专利权的期限为十五年，均自申请日起计算。自发明专利申请日起满四年，且自实质审查请求之日起满三年后授予发明专利权的，国务院专利行政部门应专利权人的请求，就发明专利在授权过程中的不合理延迟给予专利权期限补偿，但由申请人引起的不合理延迟除外。为补偿新药上市审评审批占用的时间，对在中国获得上市许可的新药相关发明专利，国务院专利行政部门应专利权人的请求给予专利权期限补偿。补偿期限不超过五年，新药批准上市后总有效专利权期限不超过十四年。第四十三条 专利权人应当自被授予专利权的当年开始缴纳年费。
一般情况下，专利在审查后撤回的，是不能退费的。
法律分析：撤回专利申请后，申请人可以向专利管理部门申请退还申请费，符合退费条件的，专利管理部门会退还费用。法律依据：《中华人民共和国专利法实施细则》 第九十四条 专利法和本细则规定的各种费用，可以直接向国务院专利行政部门缴纳，也可以通过邮局或者银行汇付，或者以国务院专利行政部门规定的其他方式缴纳。通过邮局或者银行汇付的，应当在送交国务院专利行政部门的汇单上写明正确的申请号或者专利号以及缴纳的费用名称。不符合本款规定的，视为未办理缴费手续。直接向国务院专利行政部门缴纳费用的，以缴纳当日为缴费日邮局汇付方式缴纳费用的，以邮局汇出的邮戳日为缴费日银行汇付方式缴纳费用的，以银行实际汇出日为缴费日。多缴、重缴、错缴专利费用的，当事人可以自缴费日起3年内，向国务院专利行政部门提出退款请求，国务院专利行政部门应当予以退还。
可能是因为你没有及时缴纳费用或没有按时补正等原因导致专利审查结束，于是，专利发文，视为撤回，如果没有公布的话，应该是视为未提交。
法律分析：下列情形视为专利申请撤回：没有按期缴纳专利申请费和印刷费。没有按期答复审查员的补正通知书。没有按期缴纳第一次维持费和滞纳金。没有按期提交实质审查请求书和缴纳实质审查费。没有按期答复审查员的审查意见通知书。没有按期缴纳维持费和滞纳金。法律依据：《中华人民共和国专利法》 第三十五条 发明专利申请自申请日起三年内，国务院专利行政部门可以根据申请人随时提出的请求，对其申请进行实质审查；申请人无正当理由逾期不请求实质审查的，该申请即被视为撤回。国务院专利行政部门认为必要的时候，可以自行对发明专利申请进行实质审查。
法律分析：一、主动撤回申请人可以在被授予专利权之前随时撤回其专利申请。二、视为撤回(1)发明专利申请自申请日起三年内，国务院专利行政部门可以根据申请人随时提出的请求，对其申请进行实质审查;申请人无正当理由逾期不请求实质审查的，该申请即被视为撤回。(2)发明专利的申请人请求实质审查的时候，应当提交在申请日前与其发明有关的参考资料。发明专利已经在外国提出过申请的，国务院专利行政部门可以要求申请人在指定期限内提交该国为审查其申请进行检索的资料或者审查结果的资料;无正当理由逾期不提交的，该申请即被视为撤回。(3)国务院专利行政部门对发明专利申请进行实质审查后，认为不符合法律规定的，应当通知申请人，要求其在指定的期限内陈述意见，或者对其申请进行修改;无正当理由逾期不答复的，该申请即被视为撤回。法律依据：《中华人民共和国专利法》 第二十二条 授予专利权的发明和实用新型，应当具备新颖性、创造性和实用性。 新颖性，是指该发明或者实用新型不属于现有技术；也没有任何单位或者个人就同样的发明或者实用新型在申请日以前向国务院专利行政部门提出过申请，并记载在申请日以后公布的专利申请文件或者公告的专利文件中。 创造性，是指与现有技术相比，该发明具有突出的实质性特点和显著的进步，该实用新型具有实质性特点和进步。 实用性，是指该发明或者实用新型能够制造或者使用，并且能够产生积极效果。 本法所称现有技术，是指申请日以前在国内外为公众所知的技术。
法律分析：申请人可以在被授予专利权之前随时撤回其专利申请。另外在专利授权后可以依照专利法的规定在专利权授予后无效、放弃或者停缴年费。法律依据：《中华人民共和国专利法》 第十条 专利申请权和专利权可以转让。中国单位或者个人向外国人、外国企业或者外国其他组织转让专利申请权或者专利权的，应当依照有关法律、行政法规的规定办理手续。转让专利申请权或者专利权的，当事人应当订立书面合同，并向国务院专利行政部门登记，由国务院专利行政部门予以公告。专利申请权或者专利权的转让自登记之日起生效。
专利申请主动撤回的方式：在专利被授予专利权之前，申请人可以向国务院专利行政部门提出书面撤回申请，即可撤回专利申请。若在授权过程中，申请人无正当理由逾期不请求实质审查的，申请可以被视为撤回。【法律依据】《中华人民共和国专利法》第三十二条申请人可以在被授予专利权之前随时撤回其专利申请。第三十五条发明专利申请自申请日起三年内，国务院专利行政部门可以根据申请人随时提出的请求，对其申请进行实质审查；申请人无正当理由逾期不请求实质审查的，该申请即被视为撤回。第三十六条发明专利已经在外国提出过申请的，国务院专利行政部门可以要求申请人在指定期限内提交该国为审查其申请进行检索的资料或者审查结果的资料；无正当理由逾期不提交的，该申请即被视为撤回。第三十七条国务院专利行政部门对发明专利申请进行实质审查后，认为不符合本法规定的，应当通知申请人，要求其在指定的期限内陈述意见，或者对其申请进行修改；无正当理由逾期不答复的，该申请即被视为撤回。