一般会让修改一到两回。中国中药杂志由中国药学会主办。是我国现存创刊最早的综合性中药学术核心期刊，始终保持发行量居本专业领域首位。
投稿后—稿件编辑前退稿，需向编辑部书面说明情况，并附文章所有作者的亲笔签名，提交所有署名作者身份证复印件，由此带来的一切损失由作者自行承担。
不会的。杂志退稿会通过邮箱通知的。中医杂志是由中华中医药学会，中国中医科学院主办的专业学术期刊，中医杂志创始于1951，杂志的期刊级别是：核心期刊，属于半月刊，并且在国内外公开发行。中医杂志杂志对来稿质量要求很高，因此退稿率也较高，但是中医杂志编辑部的审稿效率很高，不会耽误作者时间，作者可以根据专家给的审稿意见认真修改。
新人从小杂志开始投吧，通常来说稿费低一点的杂志要求也会低一些建议你去 品 优 刊，豆瓣稿费银行，天使领域-浮云殿看看里面有各种类型杂志或是报刊的约稿函，稿费标准，征稿要求都有明确的标注
你好。这个是期刊。是医学类的北大核心刊物
杂志，能是报纸吗？这个问题有点
目前作为课题负责人主持国家自然科学基金青年项目、高等学校博士学科点专项科研基金、中国博士后科学基金特别资助项目、中国博士后科学基金面上项目、山东省科技发展计划项目、山东省博士后创新基金、山东大学自主创新基金等，参与多项国家自然科学基金课题的研究。在Medicinal Research Reviews、J Med Chem、Eur J Med Chem、Bioorg Med Chem、Bioorg Med Chem Lett、Chem Biodivers、Med Chem Res、Antiviral Research、PLoS ONE、Curr Med Chem、Mini Rev Med Chem、Expert Opin Ther Pat、药学学报、中国药物化学杂志、中国药学杂志、中国新药杂志、生命的化学等国内外学术期刊发表论文100余篇，其中作为第一作者及共通讯作者的SCI论文40余篇，影响因子累计逾150，引用总数200余次，国内外会议论文30余篇；以第一发明人申请国家发明专利1项，以第二发明人申请发明专利9项，授权6项（第二完成人）；参编专著1部。获2012年全国百篇优秀博士论文提名，2011年山东省优秀博士毕业论文，2010年山东高等学校优秀科研成果奖一等奖（第二完成人），2010年山东省研究生优秀科技创新成果奖一等奖等。担任Symbiosis Journal of Virology & Retrovirology，Journal of Drug Design and Research，Hans Journal of Medicinal Chemistry编委；Expert Opin Ther Pat，Expert Opinion On Drug Discovery特邀撰稿人；Curr Med Chem，Bioorg Med Chem，Bioorg Med Chem Lett，Eur J Med Chem, Mini-Reviews in Organic Chemistry, Current Organic Chemistry, Med Chem Res,Current Green Chemistry, Medicinal Chemistry Communications, Drug Target Insights,Eur Journal of Chemistry,Letters in Drug Design & Discovery，Expert Opin Ther Pat,Arabian Journal of Chemistry, Acta Pharmaceutica Sinica B等国际学术杂志审稿人，Elsevier Science PublishersEBook“Studies in Natural Products Chemistry (Bioactive Natural Products)”评阅人，Hans Journal of Medicinal Chemistry特约审稿人；the International Workshop on Chemical Science and Pharmaceutical Research (CSPR2014)会议论文特邀审稿人，Asian Council of Science Editors (ACSE)会员，波兰国家自然科学基金评审专家。
还有新创刊的《中国药物评价》杂志，论文水平还不错。
核心期刊：国内目前公认的核心期刊是指北京大学的《中文核心期刊要目总览》中确定的核心期刊；ISSN：国际标准连续出版物号。国内药学核心期刊：药学学报 中国药学杂志 中国药理学通报 中国新药杂志 中国药科大学学报 药物分析杂志 中国医院药学杂志 中国医药工业杂志 毒理学杂志 中国抗生素杂志 中国临床药理学杂志 沈阳药科大学学报 中国新药与临床杂志 国际药学研究杂志 中国药理学与毒理学杂志 中国药房
找权威期刊可以到佰腾科研导航站上去找找，这个站一般做学术的人都会看，上面列出来的期刊杂志都是某个领域内最权威的~~
药学学报 ，中国药学杂志 ， 中国药理学通报，药物分析杂志，中国新药杂志，中国新药与临床杂志，中国医院药学杂志，中国医药工业杂志，中国药科大学学报，中国抗生素杂志，沈阳药科大学学报，中国药理学与毒理学杂志，中国临床药理学杂志，中国药房，中国生化药物杂志，中国现代应用药学，华西药学杂志，安徽医药，白云医药，北方药学，毒理学杂志，儿科药学杂志，广东药学院学报，国际药学研究杂志，国外药讯，国外药讯﹒抗生素分册，海峡药学，华东医药通讯，家庭用药，江苏医药，解放军药学学报，今日药学，抗感染药，辽宁医药，临床药物治疗杂志，临床医药实践，齐鲁药事，人参研究，上海食品药品监管情报研究，上海医药，实用临床医药杂志﹒综合版，实用药物与临床，食品与药品，世界临床药物 ，天津药物，西北药学杂志，新兴医药三，药品评价﹒肝病专辑，药品评价﹒糖尿病专辑，药物不良反应杂志，药物流行病学杂志，药物生物技术，药物与人，药学服务与研究，药学教育，药学进展，药学实践杂志，药学与临床研究，医药导报 ，医药工程设计，医药快讯，中国处方药，中国感染与化疗杂志，中国临床药理学与治疗学，中国临床药学杂志，中国生物制品学杂志，中国食品药品监督管理年鉴，中国食品药品年鉴，中国天然药物，中国药店，中国药理通讯，中国药品标准，中国药师，中国药事，中国药物化学杂志，中国药物滥用防治杂志，中国药物依赖性杂志，中国药物应用与监测，中国药物与临床，中国药学文摘，中国药业，中国医药导刊，中国医药技术与市场，中国医药生物技术，中国医院用药评价与分析 ，中国制药信息， 中南药学等。中国药学杂志 ， 中国药理学通报，药物分析杂志，中国新药杂志，中国新药与临床杂志，中国医院药学杂志，国际药学研究杂志，毒理学杂志等比较好，也比较实用。
不用的，写简介一般都是长篇投稿需要，杂志不需要，写了反而让编辑觉得你很拿乔，但是作者的联系方式倒是要具体写清楚。你多看看杂志约稿吧，上面都有具体要求的。
中成药杂志没有两次外审。中成药杂志于1978年创刊，由国家食品药品监督管理局、信息中心中成药信息站主办，是一本月刊，杂志的质量很不错，学术影响力极高。期刊在中国医学类期刊中被引频率排行第1位，药学类期刊被引频率排行第2位，中国医学类各学科论文引用期刊分布排行第1位。据了解，中成药杂志外审时间一般需要2-3个月左右，具体时间要看文稿的质量、创新性。
这个可以到国家新闻总署去看看的，这个是有很多的。不过过核心类的难度是比较大的，所以就是先要把自己的文章先写好。
在国内外期刊发表论文90多篇,2000年后发表论文70多篇：其中Sci论文4篇、核心期刊47篇、第一作者42篇、通讯作者10篇。主编（译）专著5部；参与编写、翻译出版专著8部。完成农业部“水稻病虫害网络专家诊断系统”病害部分内容。 1. 南方优质稻米生产技术：中鉴100和中香1号生产技术 黄发松主编、参编 中国农业出版社ISBN7 -80119-433-O/S.232 2002-062. 浙江效益农业百科全书：优质稻 参编 中国农业出版社ISBN7 -80119-433-O/S.232 2002-063. 水稻杂草防除—全球综合状况（原著：联合国粮农组织之粮农组织植物生产与保护论文集139） 参译（第11章） 中国农业科学技术出版社 2002-104. 优势农产品生产技术规范 (水稻病虫害综合防治技术) 参编 中国农业出版社 2004-025. 水稻病虫害诊断与防治原色图谱 傅强、黄世文主编 金盾出版社 2005-036. 农民增收百项关键技术丛书：优质水稻品种及栽培关键技术 参编 中国三峡出版社农业科教出版中心 2006-017. 超级稻栽培技术 黄世文副主编 金盾出版社 2006-128. 中国现代水稻 参编第13章4万字 金盾出版社 2007-019. 2009年中国水稻产业发展报告 参编 中国农业出版社 2009-0810. 水稻生产100问：水稻技术100问/现代农业产业技术一万个为什么 参编 中国农业出版社 2009-0311. 水稻病虫害及防治原色图册 傅强、黄世文、谢茂成主编 金盾出版社 2009-1112.水稻主要病虫害防控关键技术解析 黄世文、王玲、刘连盟主编 金盾出版社 2010-0413. 稻田浮萍：农业综合体系中多功能小型水生植物,原著：Ronald A. Leng 黄世文、王玲、刘连盟主编译 中国农业科学技术出版 2010-06 201173.对中国南方部分籼型杂交水稻纹枯病抗性的评价 王玲, 黄雯雯, 刘连盟, 傅强, 黄世文* 作物学报, 2011, 37(2): 263-270201072. 5个水稻品种对水稻纹枯病菌鉴别能力的比较 王玲，黄雯雯，刘连盟，刘恩勇，范锃岚， 黄世文* 中国稻米，16(2): 36-3871. 水稻纹枯病立枯丝核菌的分类及遗传多样性研究进展 黄雯雯，王玲，刘连盟，刘恩勇，黄世文* 中国稻米，16(3): 34-3870. 水稻稻曲病G蛋白β亚基基因的克隆、表达与序列分析 刘连盟，王玲，黄雯雯，刘恩勇，黄世文* 中国水稻科学，2010，24(4): 353-35969. 浙皖鄂地区水稻纹枯病菌5个种群的遗传结构分析 王玲, 黄雯雯, 黄世文*, 刘连盟, 刘恩勇. 生态学报，201030(20): 5439-544768. Rice spikelet rot disease in China–1. Characterization of fungi associated with the disease Shi-wen Huang, Ling Wang, Lian-meng Liu, Shao-qing Tang, De-feng Zhu, Serge Savary*(Sci) Crop Protection, 2011, 30(1): 1-967. Rice spikelet rot disease in China–2. Pathogenicity tests, assessment of the importance of the disease, and preliminary evaluation of control options Shi-wen Huang, Ling Wang, Lian-meng Liu, Shao-qing Tang, De-feng Zhu, Serge Savary*(Sci) Crop Protection, 2011, 30(1): 10-1766. 皖鄂地区水稻纹枯病菌致病力分化研究 王玲, 黄雯雯, 黄世文*, 刘连盟, 刘恩勇 中国水稻科学, 2010, 24(6): 623- 629200965. 水稻后期穗部病害---穗腐病研究 黄世文, 王玲, 刘连盟, 黄雯雯, 朱德峰 中国植物病理学会2009年学术年会论文集，p206. 彭友良，朱有勇主编，2009,7月，中国农业科学技术出版社64. 水稻纹枯病抗性研究进展（综述） 鄂志国，张丽靖，黄世文，王磊 核农学报, 2009, 23 (6): 997-100063. 水稻纹枯病寄主－病原物互作鉴别品种与菌株的筛选 陈夕军, 王玲, 左示敏, 王子斌, 陈宗祥, 张亚芳, 鲁国东, 郭泽建*, 黄世文*, 潘学彪* 植物病理学报, 2009, 39(5):514-52062. 植物抗病促生蛋白对粳稻生理生态特性的影响 黄世文，王全永，王玲，黎起秦 中国稻米,2009,16(6): 27-3261. 三种研究农田土壤微生物多样性方法的比较 王玲，黄世文*，黄雯雯，刘连盟 科技通报2009, 25(5): 588-59260. 水稻主要病虫害“傻瓜”式防控技术理论与实践（2） 黄世文，黄雯雯，王玲，刘连盟 中国稻米, 2009, 16(5): 48-5159. 水稻主要病虫害“傻瓜”式防控技术理论与实践（1） 黄世文，黄雯雯，王玲，刘连盟 中国稻米, 2009, 16(4): 13-1658. 氮肥施用量和施用方法对超级杂交稻纹枯病发生的影响 黄世文, 王玲, 陈惠哲, 王全永, 朱德峰 植物病理学报, 2009, 39 (1): 104-10957. 水稻重要病虫草害综合防治核心技术 黄世文, 王玲, 黄雯雯, 刘连盟 中国稻米, 2009, 16（2）: 55-56200856. 转真菌蛋白基因水稻生物学性状观察及抗病性鉴定 黄世文, 王玲, 王全永，毛建军, 邱德文 浙江农业科学, 2008, 1:85-8755. 土壤中有益放线菌的高效分离、筛选和生物测定技术 黄世文, 高成伟, 王玲, 王全永 植物保护, 2008, 34(1):138-14154. 纹枯病菌对不同水稻品种叶片中抗病性相关酶活性的影响 黄世文, 王玲, 王全永, 唐绍清, 陈惠哲, 鄂志国，王磊, 朱德峰 中国水稻科学, 2008, 22 (2)：219-22253. 水稻品种ZH5及其杂交后代纹枯病抗性和农艺性状研究 黄世文, 王玲, 王全永, 唐绍清 杂交水稻, 2008, 23(4):7-1152. 新月弯孢菌CLE菌株胞外蛋白对水稻纹枯病的诱导抗性及其菌种鉴定 王玲, 黄世文*, 唐绍清, 朱德峰, 王 磊. 中国生物防治, 2008, 24 (3): 257-26151. 稗草病原真菌AAE的分子鉴定及其粗蛋白诱导水稻的稻瘟病抗性 王玲, 黄世文*, 王全永, 鄂志国, 王磊, 张建萍, 朱德峰, 傅强 中国水稻科学, 2008, 22 (3): 327-33050. 植物生长素对水稻叶片衰老及抗氧化酶活性的影响 王玲、黄世文*、王全永、朱德峰 浙江农业科学, 2008, 3, 310-31349. 新奇生物制剂对籼稻功能的影响 王全永 黄世文* 王玲 黎起秦 浙江农业科学, 2008, 6: 707-71248. 水稻干尖线虫病在籼粳杂交晚稻上危害及防治 王 玲, 黄世文*, 禹盛苗, 许德海 中国稻米, 2008, 15(5): 65-6647. 抗褐飞虱和抗除草剂转基因粳稻新品系的选育及其中间试验 王玲, 于恒秀, 黄世文, 赵志鹏, 龚志云, 汤述翥, 顾铭洪, 刘巧泉 扬州大学学报(农业与生命科学版), 2008, 29 (3): 23-27200746. 一份抗纹枯病优质水稻品种ZH5的抗病虫特性和生物学性状 黄世文, 王 玲, 王全永, 唐绍清等 中国水稻科学, 2007, 21(6): 657-66345. 两种氮肥用量对超级稻产量性状和病虫害发生的影响 王 玲, 黄世文*, 林贤青等 植物保护, 2007, 33 (3): 76-7944. 利用啤酒和味精废水开发微生物发酵培养基及其应用研究 黄世文, 王 玲, 王全永 上海环境科学, 2007, 26 (4):180-18443. 植物激活蛋白诱导的生物化学活性及其应用 王全永, 黄世文*, 王 玲, 黎起秦 植物保护, 2007, 33 (4): 20-2342. 利用工农业废水开发微生物发酵培养基及其应用研究 黄世文, 王 玲, 王全永 浙江农业科学2007, 4: 476-48041. 工农业发酵废水生物处理及应用研究进展 黄世文, 王 玲, 王全永 中国生物防治, 2007, 23 (增刊):70-75200640. 沼肥在水稻上的应用效果分析 王 玲, 黄世文*, 刘经荣, 袁翠枝 江西农业学报, 2006, 18(5): 42-45200539. 两株放线菌对多种病原真菌抑菌效果及发酵培养基筛选 黄世文、卢继英、王玲、黎起秦 农业生物灾害预防与控制研究, 中国农业出版社, p: 664-67038. 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Inhibiting efficacy of metabolites of Streptomyces lavendulohygtroscopicus and its ultraviolet induced strain on two rice diseasesHuang shiwen, Yu liuqing Chinese Rice Research Newsletter (CRRN), 2000, 8 (2): 5-62. Study on the biological control of barnyard grass (Echinochloa spp.) with fungi pathogens Huang S., Watson AK et al Abstracts of International Rice Research Conference: 31 March-3 April, Published by IRRI, 2000. P: 2001. Rice Pest Constrainst in Tropicl Asia: Characterization of Injury Profiles in Relation to Production Situations Serge Savary, Laetitia Willocquet, Francisco A. Elazegui, Paul S. Teng, Pham Van Du, Defeng Zhu, Qiyi Tang, Shiwen Huang, Xianquing Lin, H. M. Singh, and R. K. Srivastava (Sci) Plant Disease, 2000, 84 (3): 341-356
1968年3月11日出生于湖南省华容县。1990年7月湖南农业大学农学专业毕业，获农学学士学位。1993年7月本校作物遗传育种专业硕士毕业，获农学硕士学位。 1993年7月硕士研究生毕业后留校工作。1999年7 月本校作物栽培学与耕作学专业博士毕业，获博士学位。2004年4月在该校作物学博士后流动站（湖南金健米业股份有限公司博士后工作站）完成博士后科研工作，获博士后证书。 自1993年7月始一直在学校从事教学、科研和管理方面工作。在农学系作物遗传教研室从事教学、科研工作，先后担任过教研室秘书、副主任、水稻科学研究所副所长、所长、农学院工会主席、农学院副院长、院长、湖南农业大学科技处处长和2011协同创新管理办公室主任等职务，是中国遗传学会、中国农学会、湖南省作物学会常务理事，湖南省稻米协会副会长，湖南省标准化服务委员会委员，《中国稻米》和《湖南农业科学》等杂志编委，新疆农业大学特聘教授，湖南省农作物品种审定委员会委员。 1996年7月获得中级专业技术职务任职资格， 2001年7月获得副教授专业技术职务任职资格，2007年10月获得正教授专业技术职务任职资格，2002年4月被遴选为作物遗传育种专业硕士导师，2003年5月被聘为湖南农业大学种子科学与工程专业硕士点领衔人，2013年被聘为湖南农业大学作物学一级学位点博士生导师，2006年被确认为湖南省青年骨干教师，先后获得过湖南农业大学优秀班主任、优秀教师、优秀党员、拆迁宣教先进个人和基础研究管理先进个人、全国粮食生产有突出贡献的农业科技人员等荣誉称号。
水稻微生物组动态变化揭示核心垂直传播的种子内生微生物期刊：MicrobiomeIF：16.837发表时间：2022.12.9第一作者：张晓霞，马毅楠通讯作者：魏海雷通讯作者单位：中国农科院农业资源与农业区划研究所DOI号：10.1186/s40168-022-01422-9实验设计实验设计图：本研究基于两代水稻、6个品种(RBQ、L31、M63、P64、Dular和Kasalath)、4个种植区(三亚、廊坊、南昌和西双版纳)、5个取样部位(散土、根际土、根内、茎内、种子内)的481份样品进行了高通量微生物组深度解析。 结果1.水稻微生物群落多样性及其驱动因素 作者利用Chao1和Shannon指数描述样品的α-多样性后发现，同一水稻品种的根际、根、茎和种子内生微生物在不同地区的α-多样性没有显著差异。此外，6个水稻品种的根际、根内、茎内和种子内样品的α-多样性指数在4个种植地点没有显著差异，说明水稻基因型对微生物多样性没有影响。此外，根际和散土微生物群落的α-多样性在4个种植地点具有明显的差异，然而，内生微生物(茎、根和种子)多样性在4个地点具有不同的分布，表明外界环境对水稻内部的微生物多样性影响不大。重要的是，作者还发现水稻微生物的α-多样性不受品种和种植地区的影响，始终呈现从根际、根、茎到种子内降低的规律。 图1 水稻相关微生物群落的α-多样性。d和g, 6个水稻品种不同取样部位的4个种植地区合集的Chao1和Shannon指数。e和h, 4个种植地区6个水稻品种不同微生境微生物区系的Chao1和Shannon指数。f和I, 不同取样部位的所有水稻品种和种植地区合集的Chao1和Shannon指数。通过基于Bray-Curtis相异性的PCoA分析，结果显示取样部位是微生物组变异的最主要影响因素(R2 = 0.314, p < 0.001)，而受种植地区(R2= 0.0967, p < 0.001)和水稻品种(R2 = 0.0106, p = 0.478)的影响较小。可见，取样部位是水稻微生物组组成的主要驱动力。这些数据表明，水稻微生物群落的多样性从根部远处到近处、从外部到内部、从地下到地上呈稳步下降趋势。图2 基于Bray-Curtis相异性的水稻取样部位、种植地区和品种的PCoA分析。 2.水稻微生物的群落组成及动态变化 为了调查水稻微生物的群落组成及动态变化，作者分析了在不同条件下的水稻微生物群落富集和组成情况。对于散土样品，三亚种植区的β-变形菌纲(Betaproteobacteria)的占比最高(57.9%)，而其他细菌菌纲占比均小于10%。相比之下，放线菌纲(Actinobacteria)广泛分布在廊坊和西双版纳种植区，而疣微菌门(Verrucomicrobia subdivision 3)在南昌种植区显著富集。根际土样品细菌群落组成与散土样品十分相似，但少数类群在这两种取样部位间变化明显，例如β-变形菌纲(Betaproteobacteria)。γ-变形菌纲(Gammaproteobacteria)是唯一一个在散土、根际、根、茎和种子中逐渐富集的菌纲，而放线菌纲、α-变形菌纲和β-变形菌纲逐渐减少，说明水稻内部生态位更加有利于γ-变形菌纲的生存。因此，来自于γ-变形菌纲的泛菌属(Pantoea)和黄单胞菌属(Xanthomonas)比来自α-变形菌纲的鞘氨醇单胞菌属(Sphingomonas)和β-变形菌纲的食酸菌属(Acidovorax)在研究水稻内生方面更加具有优势。此外，在不同取样部位中丰度最高的前五个菌纲和菌属呈现动态变化，在子代种子样品中，γ-变形菌纲和泛菌属最为优势。图3 水稻取样部位微生物群落组成。a,纲水平散土、根际土、根内、茎内、子代种子和亲代种子内生微生物组成柱状图。b, 纲水平各取样部位前五汇总图。c, 属水平散土、根际土、根内、茎内、子代种子和亲代种子内生微生物组成柱状图。d, 属水平各取样部位前五汇总图。3.细菌共现性网络和关键类群 通过构建不同取样部位的细菌共现性网络，作者进一步解析了细菌类群和取样部位间复杂相互作用对水稻微生物群落组成的影响。总体而言，网络的复杂性从根际、根内、茎内到种子内逐步降低。根据模块化指数可以观察到地下部分(散土、根际土和根内)比地上部分(茎内和种子内)具有更明显的模块化趋势。子代种子内样品的网络节点数、边数和平均聚类系数均为最低，网络组成最为简单。由此可见，取样部位对微生物网络的构建具有显著影响。作者根据网络节点解析微生物群落中的关键微生物。网络节点中变形菌门数量最多，且在茎内和种子内生样品中所有的节点微生物都来自变形菌门，说明该菌门在水稻内生微生物组中的重要地位。图4 基于SparCC构建的微生物网络及网络参数。a, 水稻微生物组不同取样部位间的共现性网络。每个节点代表一个细菌ASV，青色标记代表网络节点，边的颜色代表作用类型，红色代表正相关，蓝色代表负相关。b, 各取样部位间微生物网络的主要拓扑结构特征。4.水稻核心内生菌群 为了挖掘能够在水稻中垂直传播的核心内生微生物类群，作者首先以大于70%的阈值在不同地点、水稻品种和微生境中提取核心ASV，最终在根、茎和子代种子内生样品中分别发现了438个、94个和27个ASV，其中三者共有的ASV为14个，分布在两个菌门，6个菌目。因此，作者推测水稻核心内生菌群的组成并不完全随机，而是受到了细菌特征、宿主环境和代谢特点的影响。图5 水稻核心内生微生物和垂直传播类群。a, 韦恩图显示高频率出现在水稻内生取样部位(根内、茎内和种子内)的ASV。b, 韦恩图展示10个潜在的从亲本种子垂直传播到子代种子的ASV。c, 在不同取样部位的潜在垂直传播ASV的绝对丰度。5.种子内生菌垂直传播的证据 为了鉴定潜在的垂直传播细菌类群，作者分析了核心内生菌和亲代种子内生样品之间的重叠ASV，发现在14个共有内生ASV中，10个均来自亲代种子内生样品。同时ASV_2 (Pantoea)、ASV_26 (Pseudomonas)、ASV_48(Xanthomonas)和ASV_238(o_Enterobacterales)在根内、茎内、亲代种子和子代种子样品中的绝对丰度和出现频率均显著高于散土和根际土样品，表明这4种ASV最有可能是垂直传播的类群。 为进一步获得垂直传播的细菌类群，作者对种子内生细菌进行了高通量地分离、培养、纯化和鉴定，从4个种植地区和2个水稻品种(P64和Dular)的亲子代种子中分离获得了957株细菌。其中泛菌和黄单胞菌是数量最多的两个细菌菌属，分别占分离菌株的39.39%和27.69%。21株泛菌和27株黄单胞菌的部分16S rRNA基因序列分别与ASV_2和ASV_48序列完全相同。其中，9株泛菌和17株黄单胞菌来源于子代种子样品，其余均来自亲代种子样品。作者对这些菌株进行了基因组草图测序并进行了系统发育分析，发现分离获得的泛菌菌株分别属于P. ananatis、P. dispersa和 P. stewartia三个种，黄单胞菌均为X. sacchari种。通过比对亲代和子代的ANI值和核心基因组的相似性，发现来源于子代种子的8株泛菌与来源于亲代种子的9株泛菌具有极高的相似性；来自子代种子样品的4株黄单胞菌与来自亲代的4株菌株黄单胞菌具有极高相似性。以上结果表明种子内生菌在株系水平上存在垂直传播。图6 可培养的垂直传播水稻种子内生菌鉴定。a, 四个水稻种植区、两个水稻品种的亲代种子和子代种子中分离获得的可培养细菌菌株数量。b,圈图展示a中菌株属水平相关关系。c, 亲代种子和子代种子样品中分离的泛菌菌株ANI热图。d, 亲代种子和子代种子样品中分离的泛菌菌株串联核心基因组一致性热图。e, 亲代种子和子代种子样品中分离的黄单胞菌菌株ANI热图。f, 亲代种子和子代种子样品中分离的黄单胞菌菌株串联核心基因组一致性热图。6.可垂直传播的种子内生菌群基因组挖掘和功能特征 为了进一步阐明水稻中可垂直传播类群的潜在功能，作者对所有已测序的内生泛菌和黄单胞菌菌株进行基因组挖掘分析。作者计算了泛菌和黄单胞菌的泛基因和核心基因数量，并利用COG和KEGG数据库对核心基因进行了功能注释。在COG注释中，核心基因组显著富集在E(氨基酸转运和代谢)和G(碳水化合物转运和代谢)两个功能类别中，且KEGG注释中同样存在高度相关的 “碳水化合物代谢”和“氨基酸代谢” 通路。随后，作者重点关注了级代谢产物、蛋白质分泌系统和酶三大功能类别，分析中发现所有泛菌菌株都含有促进植物生长相关的1-氨基环丙烷-1-羧酸(ACC)脱氨酶和吲哚乙酰胺水解酶(iaaH)。此外，所有泛菌基因组中都具有编码多种消化酶的基因，如右旋糖酶、β-半乳糖苷酶、果胶酶、纤维素酶和淀粉酶基因。并且均具有T1SS、T5aSS和T6SS，而只有少数菌株具有T2SS、T3SS、T4SS、T5bSS和T5cSS。黄单胞菌基因组中也具有iaaH基因和丰富的消化酶编码基因如β-半乳糖苷酶、淀粉酶和果胶酶基因。然而，分离出的黄单胞菌菌株基因组中仅含有T1SS、T4SS和T5SS，而不含致病性T3SS和T6SS。随后作者对部分泛菌和黄单胞菌进行了一些促生功能特征的检测并发现所有菌株都具有纤维素酶活性，并能够产生吲哚-3-乙酸(IAA)，这与基因组挖掘的结果相对应。图7 水稻种子垂直传播内生菌的系统发育分析。a, 基于1258个单拷贝同源基因的串联多序列比对建立的21株泛菌菌株与20株模式菌株的最大似然发系统发育关系。b, 基于892个单拷贝同源基因的串联多序列比对建立的27株泛菌菌株与22株模式菌株的最大似然发系统发育关系。SM，次生代谢产物；PSS，蛋白质分泌系统；ENZ，消化酶。总结本研究建立了水稻内生微生物资源库，并通过多尺度微生物组学分析，阐明了种子内生微生物组中核心类群的垂直传播与功能特征，对未来开发种子内生菌并提高植物适应性奠定了理论基础。对进一步理解微生物-植物共进化理论提供了新的证据。水稻内生微生物资源在营养转化与吸收、抗病抗逆、耐胁迫等方面表现出的巨大潜力，也为微生物肥料、微生物农药、微生物种衣剂、微生物防腐剂的研发开辟了新的思路。中国农科院农业资源与农业区划研究所张晓霞研究员和马毅楠博士后为该论文的共同第一作者，魏海雷研究员为通讯作者。该研究得到国家自然科学基金、中国农业科学院科技创新工程等项目资助。