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超级吃货两枚
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快乐的森蝶

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马铃薯是全球性的重要作物,目前商业种植主要采用的是同源四倍体马铃薯块茎,运输和种植都多有不便。因此如果能使用二倍体马铃薯种子种植将会降低种植成本,便于马铃薯育种。但目前马铃薯基因组进化和物种多样性的研究十分有限。而本文填补了马铃薯泛基因组进化的空白并为马铃薯基因组设计育种提供了新的见解。

作者基于432个马铃薯株系建立起的系统发育树中选取了44个代表性株系,对其进行了Pacbio HiFi测序。并且在这44个株系中又选择了7个株系进行Hi-C测序并组成完整的基因组。

接下来为了构建马铃薯全基因库,作者利用44株马铃薯代表性物种+现有的一个马铃薯参考基因组 S. tuberosum Group Phureja 构建了泛基因组。通过聚类预测基因模型作者发现当马铃薯物种数在40左右的时候, 泛基因组规模(聚类预测基因数量)增大到了一个瓶颈。说明此时泛基因组已经能够反映物种的核心基因情况 。因此作者根据基因簇出现频率将其划分成四类:核心基因(core clusters ,存在于所有45份材料中)、次核心基因(soft-core clusters,存在于42-44份材料中)、边缘基因(shell clusters,存在于2-41个个体中)和特异性基因(accession-specific clusters)。这些泛基因组资源为利用马铃薯生物学和育种中的全段基因库提供了一个起点。

由于马铃薯家族遗传多样性和发育关系还未曾阐明,作者利用三代测序Pacbio从头测序了两个马铃薯的祖先种 Etuberosum ( Solanum etuberosum 和 Solanum palustre )并构建了系统发育树(Fig1a)。

结果非常Amazing!系统发育树关系显示(Fig1a)两个马铃薯的祖先种 Etuberosum ( 橙色块位置)与马铃薯家族的关系要比三个“外群”种 Lycopersicon (绿色快位置)更近, 这和刚刚的假设产生了矛盾 。此外作者分别使用单拷贝基因簇建树以及基因组随机滑窗建树,发现二者大致一致,但也存在相当数量的分歧。 这两点都说明了马铃薯家族进化关系相当复杂,在这里作者推断可能是发生了种间基因渗入 。因此采用了D统计和f4统计检测基因流及基因流动比例。D统计结果显示马铃薯家族 Petota 及其祖先Etuberosum存在明显的基因流动(fig1c),马铃薯基因组上8.4%的基因是由Etuberosum流入的。 种间基因流一定程度上解释了马铃薯家族系统发育的混乱。

采用无性繁殖获得的马铃薯容易感染块茎疾病,但实际上马铃薯可能通过扩张抗性基因库抵抗这些疾病。马铃薯的免疫系统进化值得深入研究。 在这里作者开发了新的NLR基因注释方法,其结合NLR-annotator和MAKER2两款软件,前者实现NLR基因的初步预测,后者能够根据现有Renseq数据,采用机器学习方法从头预测NLR基因并进行基因组注释 。最终二者取并集即为NLR基因重注释的结果。以此法作者注释了上述45个马铃薯家族成员一共 57,683个NLR基因。并且发现不同马铃薯种间NLR基因拷贝数差异巨大(Fig2ab)。

与祖先种 Etuberosum (ETB)和番茄基因组相比,马铃薯基因组中含有的NLR基因有了很大程度的扩张。作者将这些NLR基因分成了424个簇,其中161个簇呈现出扩张的迹象。这里面就包含了著名的 马铃薯抗性基因R3a (Fig2c)。

马铃薯块茎储存了大量的营养物质,有助于马铃薯的存活。前人为数不多的研究发现,马铃薯结块基因受到顺式作用元件(cis-regulatory elements,CREs)的调控,而后者在进化上存在规律。顺式作用元件通常以非编码的保守序列(conserved non-coding sequences,CNS)出现,作者因此根据45个马铃薯株系基因组保守性得分计算出149,663个马铃薯特异性CNS。其中54.4%CNS存在于内含子位置,可能对结薯产生潜在影响。

为了进一步定位结薯相关基因,作者在块茎中检测到732种表达的基因,在这之中229个基因关联于马铃薯特异性CNS且在45个马铃薯株系中保持了保守性(Fig3a)。前任的研究显示TCP基因家族参与分生组织的发育,而这些基因中仅一个基因(Soltu.DM.06G025210)属于TCP家族。关联于此基因的CNS位于启动子上游376bp和157bp(Fig3b),可能调控此TCP的表达。 转录组分析进一步证明了Soltu.DM.06G025210表达于马铃薯的匍匐茎或块茎,而在远亲番茄中却测不到表达(Fig3c),符合番茄到马铃薯谱系的分化特点。

紧接着, 作者为了找到与IT1互作的基因,进行了酵母双杂实验 。筛选得到了SP6A(SELF-PRUNING 6A )基因,控制着薯块维管束运输信号(Fig3f)。SP6A可能与IT1形成复合体调控薯块形成。在马铃薯祖先(ETB)中也有一段SP6A的同源序列 SP6A etb ,但是该序列在ETB中却检测不到表达(Fig3c)。于是作者对IT1及其同源进行了结构分析,结果发现其PEBP域产生了缺失(Fig3g)。 SP6A结构域的缺失导致了马铃薯祖先ETB不能结薯。

高度纯合的自交系对于杂交育种至关重要。因此作者希望调查所研究株系的纯合度以备选可能的杂交材料。此外,由于倒置(inversions)会抑制重组,在杂交的时候会产生连锁阻力,从而阻碍育种。育种需要选择含有目的基因但又不含倒置片段的物种作为供体。因此作者利用20株马铃薯地方种和4株栽培种祖先(ETB)构建了大尺度倒置图谱(Fig4a)。在这之中作者发现与参考基因组相比(DM/PG5068)马铃薯祖先种(PG5068)三号染色体上有一段5.8Mb的基因倒置(Fig4b),与控制块茎胡萝卜素合成的Y位点(Y locus)连锁。二者难以发生重组,重组事件分布图(Fig4c)也证实了这一点: 该inversion所在位置重组事件发生率急剧降低。

说明 农业上如果选择具有黄色块茎肉(胡萝卜素合成多)的个体,可能会同时选择出该倒置,从而导致表型连锁阻力。 借助这里构建的泛基因组倒置图谱,育种家能选择合适的供体或受体株系进行回交。

新颖且内容极其丰富的泛基因组研究。作者从构建马铃薯泛基因组,讨论马铃薯家族和祖先种系统发育关系。从免疫基因扩库和结薯基因上详细研究了马铃薯家族的进化关系。其结薯基因IT1的鉴定方法能结合CNS关联让人耳目一新。生信层面之外作者还进行了基因功能验证,结合CRISPR技术呈现出极为明显的结薯表型,无论是基因鉴定手段还是基因功能本身,都具有学术和应用价值。 关键一作还是个博士生(不是博后或副研),博士的悲喜并不相同,我只觉得自己太菜。

文献阅读仅供参考,如有谬误欢迎各位大佬批评指正哈。

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damaodaomao

:1、土豆中含有丰富的钾元素,能促进身体内钠的排出,调节机体酸碱平衡,降低血压。2、土豆中含有丰富的纤维素,能减少胃酸的分泌,不会对胃黏膜产生刺激作用,常吃土豆能够促进肠胃的消化功能,防止肠胃疾病的发生。3、土豆中含有丰富的维生素、优质纤维素以及微量元素、蛋白质、氨基酸等,除了维持身体正常的需要外,还能保养肌肤,抗衰老,清除色斑土豆的功效与作用有以下几种:第一种,延缓衰老,因为土豆不仅营养价值高,而且具有很好的抗衰老的作用,因为土豆中含有丰富的维生素和氨基酸,还含有多种微量元素和淀粉等物质,能够起到很好的延缓衰老的功效,而且有益于人的健康。第二种,美容养颜,因为土豆可以美白皮肤,还能够祛斑防晒爽,还能够缓解皮肤油脂分泌过多等症状,达到美容养颜的功效土豆可以补充营养,和中养胃,健脾利湿,润肠通便,降糖降脂的作用。土豆的第一个功效是可以补充营养,因为土豆可以作为主食。土豆是比较容易消化吸收的,能给人提供大量的热量,在欧美国家,特别是北美,土豆早就是作为第二主食来应用的。土豆的第二个功效就是有和中养胃,健脾利湿的功效,因为土豆中含有大量的淀粉和大量的维生素C,可以促进脾胃的消化吸收功能。第三个方面,土豆有润肠通便的作用,因为土豆中含有大量的膳食纤维,可以润肠通便,帮助机体及时的排泄一些代谢的毒素,防止便秘,另外土豆还有降糖降脂的功效,土豆能够给人提供大量的特殊的保护作用的黏液蛋白,可以促进人体的消化吸收

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沉默的苏克

一、适时播种,合理栽植春季种植*豆是非常好的,2-3月份播种最佳时间,在种植的时候,选取肥沃、透气性好的*块进行播种,每隔60厘米的距离播种一个,播种前先用除虫剂顺沟喷洒,防治地下害虫。施入充足的有机肥,并实行地膜覆盖。二、苗期管理播种后20天左右,苗出*,在苗处将膜抠破放风进入大道通风,苗长到10厘米高时,将苗周围的膜用*压严。三、肥水管理*豆种植好后,需要先蹲后促,在显蕾前,尽量不要浇水,以防地上部分疯长,而在显蕾以后,浇水施肥,以促进地下部分生长。在4月份的时候要进行中耕追肥,每亩施入30-40公斤氮肥,然后进行培*浇水,更加*壤湿度进行合理浇水,提高*豆的营养吸收能力,见干就浇,收获前十天,不浇水,避免田间出现烂薯,如果出现植株疯长,就要喷施多效唑进行合理控旺,减少植株生长的养分消耗。四、病害防治*豆容易出现晚疫病,要严格检疫,保证不从病区调种;减少病害发生,在播种之前,做好种薯处理,实行整薯整种,需要切块的,应该注意切刀充分消毒;在*豆生长过程中,如果发现有晚疫病发病植株,就要及时喷药防治,一般可用代森锰锌可湿性粉剂1000倍液进行喷雾防,每周用药一次,连续用药3-4次即可。

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iamYolandaXYZ

切块催芽,保证全苗。切块催芽每亩需种薯150千克左右。播前20~25天将种薯置于温暖有阳光的地方晒种2~3天,同时剔除病薯、烂薯,然后进行切块。切块时充分利用顶端优势,螺旋式向顶端斜切,最后按顶芽一分为二或一分为四,每块种薯保有1~2个芽眼,重量25~30克。晾干刀口后放在温度为18~20℃的室内采用层积法催芽,待芽长到2厘米左右时,放在散射光下晾晒,芽绿化变粗后播种。双膜覆盖,适时播种。一般在元月下旬至2月上旬的晴天上午,在大拱棚内实行单垄双行种植。采用大拱棚内套小拱棚可进一步提早上市。垄距80厘米,种双行,株距25~30厘米,亩种植5500~6000株。种植时开沟深8~10厘米,宽20厘米。施种肥和防治地下害虫的药剂,与土混匀,浇水后斜调角种植,芽向上,用少量细土先盖住芽,然后覆土起垄,垄高15厘米左右,把垄面搂平,喷施除草剂,然后用90厘米宽地膜进行覆盖。施肥完成以后,还需要对土地进行翻动和浇水,让肥料和土壤能够混在一起,增加土壤肥沃性。混合好以后把土地刨匀称,再让太阳晒个三五天就可以播种了。需要注意的是,播种不要选中阴雨天气,因为阴雨天气没有太阳,不利于种子的发育和生长,而且雨水可能会冲断芽苗,降低了存活率。

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咩丝忒酷

土豆有以下4大作用及功效:

1.马铃薯是非常好的高钾低钠食品,很适合水肿型肥胖者食用,加上其钾含量丰富,几乎是蔬菜中最高的,所以还具有瘦腿的功效。

2.可以用来主治胃痛、痄肋、痈肿、湿疹、烫伤,是和胃健中药和解毒消肿药,性平味甘。

3.现代研究证明,马铃薯对调解消化不良有特效,是胃病和心脏病患者的良药及优质保健品。马铃薯富有营养,是抗衰老的食物之一。

4.据国外研究显示,马铃薯中含有的抗菌成分有助预防胃溃疡,它不仅有抗菌效果功效,同时不会造成抗药性。

马铃薯(学名:SolanumtuberosumL.),属茄科一年生草本植物,块茎可供食用,是全球第四大重要的粮食作物,仅次于小麦、稻谷和玉米。马铃薯又称地蛋、土豆、洋山芋等,茄科植物的块茎。与小麦、稻谷、玉米、高粱并成为世界五大作物。

马铃薯原产于南美洲安第斯山区,人工栽培历史最早可追溯到大约公元前8000年到5000年的秘鲁南部地区。

马铃薯主要生产国有中国、俄罗斯、印度、乌克兰、美国等。中国是世界马铃薯总产最多的国家。

2015年,中国将启动马铃薯主粮化战略,推进把马铃薯加工成馒头、面条、米粉等主食,马铃薯将成稻米、小麦、玉米外的又一主粮。

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扩展资料:

生长条件

马铃薯性喜冷凉,是喜欢低温的作物。其地下薯块形成和生长需要疏松透气、凉爽湿润的土壤环境。

马铃薯对温度的要求:块茎生长的适温是16℃~18℃,当地温高于25℃时,块茎停止生长;茎叶生长的适温是15℃~25℃,超过39℃停止生长。

马铃薯传入中国只有三百多年的历史。据说是华侨从东南亚一带引进的,在21世纪中国马铃薯种植面积居世界第二位。马铃薯产量高,营养丰富,对环境的适应性较强,现已遍布世界各地,热带和亚热带国家甚至在冬季或凉爽季节也可栽培并获得较高产量。

形态特征

1.块茎形态

草本。果实为茎块状,扁圆形或高15-80厘米,球形,无毛或被疏柔毛。茎分地上茎和地下茎两部分。长圆形,直径约3-10厘米,外皮白色,淡红色或紫色。薯皮的颜色为白、黄、粉红、红、紫色和黑色,薯肉为白、淡黄、黄色、黑色、青色、紫色及黑紫色。

2.植株形态

须根系。地上茎呈菱形,有毛。初生叶为单叶,全缘。随植株的生长,逐渐形成奇数不相等的羽状复叶。小叶常大小相间,长10-20厘米;叶柄长约2.5-5厘米;小叶,6-8对,卵形至长圆形,最大者长可达6厘米,宽达3.2厘米,最小者长宽均不及1厘米,先端尖,基部稍不相等,全缘,两面均被白色疏柔毛,侧脉每边6-7条,先端略弯,小叶柄长约1-8,毫米。

伞房花序顶生,后侧生,花白色或蓝紫色;萼钟形,直径约1厘米,外面被疏柔毛,5裂,裂片披针形,先端长渐尖;花冠辐状,直径约2.5-3厘米,花冠筒隐于萼内,长约2毫米,冠檐长约1.5厘米,裂片5,三角形,长约5毫米;雄蕊长约6毫米,花药长为花丝长度的5倍;子房卵圆形,无毛,花柱长约8毫米,柱头头状。

3.果实形态

马铃薯圆球状,光滑,棕色或紫褐色,直径约1.5厘米。种子肾形,黄色。花期夏季。

参考资料:/baike.baidu.com/item/马铃薯/416928?fr=aladdin#11_2"target="_blank">百度百科-马铃薯

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一帆杰作

土豆这样做你吃过吗?

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天晴小卷XJ

马铃薯(Solanum tuberosum)又名土豆、洋芋、山药蛋等。(见右图,我自己种的)属茄科,多年生草本,但做一年生或一年两季栽培。地下块茎呈圆、卵、椭圆等形状,有芽眼;地上茎呈三角形,有毛;奇数羽状复叶,伞房花序顶生,花白、红或紫色;种子扁园形黄色,多用块茎繁殖。块茎可供食用,是重要的粮食、蔬菜兼用作物,因其营养丰富有“地下苹果”之称,是世界五大粮食作物之一(五大粮食作物系指稻、麦、玉米、高粱、马铃薯)。在欧美许多国家作为粮食作物广泛栽培。此物原产于南美洲的秘鲁安第斯山区和智利沿海地区。十五世纪初期传入欧洲,以后迅速传到世界各地。传入我国时间大约是十六世纪中期。马铃薯含热量较低,每百克为九十卡路里,而同量的大米或面粉则达到三百五十卡路里。它所含的碳水化合物及易同化于血液,能耐饥而不伤胃。马铃薯产量高,对环境的适应性较强,中国马铃薯的主产区是西南山区、西北、内蒙古和东北地区。其中以西南山区的播种面积最大,约占全国总面积的1/3。黑龙江省则是全国最大的马铃薯种植基地。利用块茎无性繁殖时,种薯在土温5~8℃的条件下即可萌发生长,最适温度为15~20℃。适于植株茎叶生长和开花的气温为16~22℃。夜间最适于块茎形成的气温为10~13℃(土温16~18℃),高于20℃时则形成缓慢。出土和幼苗期在气温降至-2℃即遭冻害。开花和块茎形成期为全生育期中需水量最大的时期,如遇干旱,每亩每次灌水15~20吨是保证马铃薯高产稳产的关键技术措施。马铃薯一般在亩产1330~1650千克的情况下约吸收氮6.65~11.65千克,磷酸2.8~3.3千克和氧化钾9.3~15.3千克。马铃薯虽能适应多种土壤,但以疏松而富含有机质的(pH5.5~6.0)黑土最为理想。密度每亩保苗不能少于4000株。专家提醒:吃土豆时一定要削皮马铃薯、红薯、芋头等薯类食物,所含营养素丰富,它所含的蛋白质和维生素C、维生素B1、维生素B2比苹果高得多,钙、磷、镁、钾含量也很高,尤其是钾的含量,可以说在蔬菜类里排第一位。薯类中含有大量的优质纤维素,有预防便秘和防治癌症等作用。那么,怎么吃薯类才能吃好呢?首先,要有量的保证,每天吃薯类食品(马铃薯、白薯、芋头)大约应在80克左右。其次是荤素搭配好,只要搭配好,可以在享受美食的同时,达到保持苗条身材的目的。在吃薯类时,要相应地减少主食的摄取,可按照薯类与主食3∶1~4∶1的比例控制。如果每天吃80克左右的薯类食品,可能有助于降低中风的危险。对于快餐中比较多的土豆泥、炸薯条,在加工过程中被氧化,破坏了大量的维生素C,使营养成分大大降低。而对于炸薯条来说,易增加脂肪的摄入量,而且炸薯条的油很难判断是否是新鲜的,加上反复高温加热,产生聚合物,像有毒物质环状单聚合物是致癌物质,所以要尽量少吃。营养学家指出,吃薯类不必担心脂肪过剩,因为它只含0.1%的脂肪,是所有充饥食物中最少的,每天多吃薯类,可以减少脂肪摄入,使多余脂肪渐渐代谢掉。但值得注意的是,薯类尤其是土豆,含有一种叫生物碱为有毒物质,人体摄入大量的生物碱,会引起中毒、恶心、腹泻等反应。这种有毒的化合物,通常多集中在土豆皮里,因此食用时一定要去皮,特别是要削净已变绿的皮。此外,发了芽的土豆更有毒,食用时一定要把芽和芽根挖掉,并放入清水中浸泡,炖煮时宜大火。另外,如果孕妇经常食用生物碱含量较高的薯类,蓄积在体内就可能导致胎儿畸形。当然,人的个体差异相当大,并非每个人食用了薯类都会发生异常,但是孕妇还是以不吃或少吃薯类为好,特别是不吃长期贮存、发芽的薯类,这一点对处于妊娠早期的妇女来说尤其重要

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