发表的论文能申请软著吗

先专利，后论文。要不你的专利让你的论文给公开了。

作者对论文的权利属于著作权。著作权是指自然人、法人或者其他组织对文学、艺术和科学作品享有的财产权利和精神权利的总称。论文属于科学作品，所以作者对论文享有的权利是著作权。

《中华人民共和国著作权法》第二条 中国公民、法人或者非法人组织的作品，不论是否发表，依照本法享有著作权。 外国人、无国籍人的作品根据其作者所属国或者经常居住地国同中国签订的协议或者共同参加的国际条约享有的著作权，受本法保护。 外国人、无国籍人的作品首先在中国境内出版的，依照本法享有著作权。 未与中国签订协议或者共同参加国际条约的国家的作者以及无国籍人的作品首次在中国参加的国际条约的成员国出版的，或者在成员国和非成员国同时出版的，受本法保护。 《作品自愿登记试行办法》第二条 作品实行自愿登记。作品不论是否登记，作者或其他著作权人依法取得的著作权不受影响。

可以。论文投稿之后可以申请专利，但是专利申请日应当在论文发表日之前，否则，申请日前公开的论文内容将破坏专利的新颖性、创造性，即使专利发明人和论文作者是同一人。