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蛋白质结构与功能的预测方法总结和资料汇总“折叠(fold)”的概念“折叠(fold)”是近年来蛋白质研究中应用较广的一个概念,它是介与二级和三级结构之间的蛋白质结构层次,它描述的是二级结构元素的混合组合方式。一.二级结构的预测方法介绍
蛋白质残基深度、柔性和功能的预测与分析.张华.【摘要】:了解蛋白质的空间结构、功能、动力学以及解析它们之间的关系对生物学研究来讲非常的重要。.蛋白质序列数据库的数据积累速度非常快,而实验测定的已知结构蛋白质的数目相对比较少。.蛋白质...
蛋白质三级结构预测:蛋白质同源家庭的分析对于确立物种之间的亲缘关系和预测新蛋白质序列的功能有重要意义,同源蛋白质(homolog)进一步划分为直系同源(ortholog)和旁系同源(paralog),前者指不同物种中具有相同功能和共同起源的基因,后者则指在
实验结果表明这种方法是可行性的,对蛋白质功能预测效果较好。论文结构如图1.1所示。蛋白质功能预测方法在蛋白质功能研究中,如果使用基于遗传学、免疫学、生物化学等的实验方法对大量的数据进行分析,将会耗费无法估计的时间和人力物力。
中山大学博士学位论文基于氨基酸序列信息的蛋白质结构与功能预测研究姓名:李占潮申请学位级别:博士专业:分析化学指导教师:邹小勇20090607基于氨基酸序列信息的蛋白质结构与功能预测研究专业:分析化学姓名:李占潮导师:邹小勇教授摘要随着人类基因组计划的顺利完成,以及...
功能相似蛋白质挖掘及蛋白质相互作用预测平台.宋宝兴.【摘要】:蛋白质之间的相互作用有的发生于蛋白质复合体内部,有的仅仅是多个或两个蛋白质之间短暂的相互作用。.这种蛋白质之间的相互作用及其不断的变化对生物体的功能、新陈代谢发挥着十分...
本文针对基于PPI网络的蛋白质功能预测方法展开研究,主要内容如下:(1)提出一种基于机器学习(层次聚类、主成分分析和多层感知器)的蛋白质功能预测方法HPMM。.该方法综合考虑蛋白质宏观和微观层面的信息,将蛋白质家族、结构域和重要位点信息作为顶点属性...
基于蛋白质相互作用网络的功能模块识别及功能预测研究.【摘要】:随着高通量实验方法的发展,可获得的全基因组范围的蛋白质相互作用(Protein-ProteinInteraction,以下简称PPI)网络数据逐步增多,使得我们可以系统地研究组成整个系统的生物分子的行为和属性...
确定一种蛋白质的结构和功能是现代生物学许多研究的基础。在过去的几十年里,人们开发了许多用于结构预测的计算工具,其中Phyre2因其强大的分析能力与简单的操作被生物科研人员广泛使用,据统计每天都有约1000个任务提交到Phyre2服务器上。
蛋白质结构与功能的预测方法总结和资料汇总.“折叠(fold)”是近年来蛋白质研究中应用较广的一个概念,它是介与二级和三级结构之间的蛋白质结构层次,它描述的是二级结构元素的混合组合方式。.是单序列预测方法中的一种,它是使用氨基酸物理化学...
因此,对基因产物——蛋白质的功能预测(proteinfunctionalprediction)是后基因组时代的一项重要任务。;借助新的实验技术例如DNA芯片、酵母双杂交系统、RNA干扰、CRISPR-Cas9,以及大...
农业与生物学院张利达zhangld@sjtu.edu蛋白质功能预测新基因的可能功能已经了解到神经纤维素nf1基因的突变与遗传性的多发性神经纤维瘤型疾病有关(neurof...
南开大学博士学位论文蛋白质残基深度、柔性和功能的预测与分析姓名:张华申请学位级别:博士专业:生物信息学指导教师:沈世镒20090401摘要了解蛋白质的空间...
机器学习技术例如SVM被用于优化预测。这篇论文结合网络分析方法和功能间相互关系去发现具有协同功能的基因簇,预测蛋白质功能。网络构建和分析的第一个任务是集成多源数据,使...
摘要:利用计算机方法分析序列中表达的结构功能的生物信息对蛋白质的功能结构注释具有重要的意义.对于所有的预测算法,优选序列特征,构建合理的蛋白质替代模型是决定其预关键...
考虑功能团间的一阶和二阶相互作用,提出了模块化聚类方法(MCM),对实验数据进行聚类分析,来预测模块内未知蛋白质的功能.通过超几何分布P值法和增、删、改相互作用...
摘要:了解蛋白质的空间结构、功能、动力学以及解析它们之间的关系对生物学研究来讲非常的重要。蛋白质序列数据库的数据积累速度非常快,而实验测定的已知结构蛋...
由于基于蛋白质相互作用网络的功能预测能整合多种数据信息,并具有从整体水平上准确预测蛋白质功能的优点,该方法已成为蛋白质功能分析及预测中的热点[2,3]蛋...
上期回顾:第七期讲述了用Perseus进行数据预处理,第八期讲述用Perseus制作火山图和聚类热图本期要点:差异蛋白的筛选和功能分析一、差异蛋白筛选1.承接上期数...
我现在做出来某条基因的全长了,要对这个序列进行分析,比如蛋白质的活性位点,预测蛋白质功能域,还有...