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Characterization of HPV integration, viral gene expression and E6E7 alternative transcripts by RNA-Seq: A descriptive study in invasive cervical cancer 通过RNA-Seq表征HPV整合,病毒基因表达和E6E7替代转录本:浸润性宫颈癌的描述性研究 Available online 13 December 2018 Genomics IF=3
Highlights • 关于宫颈癌中HPV基因表达的资料很少。 • 我们通过RNA-Seq,宫颈癌中的HPV16和HPV18表达以及E6和E7基因的剪接产物来表征。 • 该分析表明存在非整合型和/或整合的病毒DNA,HPV18反复整合在基因内。 • 对于两种病毒类型,E6 * I是最常见的转录物同种型。 • 用于HPV16的转录物同种型E6 * VI和E6 * V以及用于HPV18的E6 * X是罕见的或未检测到的。
摘要 关于浸润性宫颈癌中乳头瘤病毒基因组的表达和可变剪接的E6E7 mRNA的频率的数据较少。 我们通过RNA-Seq分析在HPV16或HPV18的22例浸润性宫颈癌中进行了HPV表达的全面表征,表征了整合/非整合型病毒DNA的存在,人类基因组中的整合位点以及E6和E7的可变剪接产物的比例。 表达模式表明存在附加型和/或整合的病毒DNA,在大多数肿瘤中检测到整合,经常发生在HPV18 +中的人类基因内和HPV16 +肿瘤中的基因间区域。 E6E7转录物的可变剪接显示E6 * I是两种病毒类型中最常见的同种型,其次是HPV16 +中的E6 * II和E6 / E7(未剪接的)转录物,以及HPV18 +肿瘤中的E6 / E7。 先前描述的用于HPV16的E6 * VI和E6 * V转录物同种型以及用于HPV18的E6 * X是罕见的或未检测到的。
检测到的/可能存在的mRNA剪切体
Figure 2 A+B: HPV16(A)或HPV18(B)感染的浸润性宫颈癌中HPV基因组表达的热图。病毒基因组表达通过对部分区域(对于E6,E7,E1,E2,L1和L2)或完整(对于E4和E5)ORF计数的读数的数量来估计。 热图与以下相关:(1)肿瘤组织学分类,如腺癌(ADC),鳞状细胞癌(SCC)或癌; (2)HPV谱系(A,B或D); (3)通过基于PCR的方法存在E1和/或E2病毒基因的破坏; (4)通过RNA-Seq分析检测到的HPV /人嵌合转录物的存在。 NA - 不可用。
HPV基因组整合
Alternative splicing along E6 and E7 ORFs
终极结论:对于包含主要病毒致癌基因(E6和E7)的选择性剪接亚型,E6 I转录本(允许E7翻译)在所有HPV16+和HPV18+样本中表达最频繁*
鱿鱼女王
癌症虽然没有被攻克,但你要始终坚信随着科学的发展,你母亲的病,千千万万的癌症病人终会战胜病魔的!病人和家人都要有这样的信念,同时积极配合医生进行正规的完整的治疗,不要去相信医院发的那些什么宣传攻癌的广告。我也是一个才治疗完的鼻咽癌患者,不到30却得到这样的病,心里的难受谁都可以想象到的,但家人的鼓励和关心给我勇气,我相信只要自己勇敢、坚强的同病魔抗争下去,终有胜利的一天!
不想在你身后
是由宫颈癌细胞中提纯的,是宫颈癌较好的肿瘤标志物。 SCC在正常鳞状上皮细胞内也存在,随着鳞状上皮细胞的增殖(恶性)而释放入血。正常人血清水平<2μg/L。异常升高可见于宫颈鳞癌,21%宫颈腺癌也有升高。肺鳞癌有较高的阳性率,各家报告从40%-100%不等,而小细胞肺癌阳性率则较低(3.7%)。食道鳞状上皮癌、口腔鳞状上皮癌皆有较高的阳性率,且随肿瘤的分期呈现不同变化(20%-80%)。可见SCC是鳞状上皮癌的重要标志物。肿瘤标志物本身的意义不是代表一定就有复发,要结合你之前的标志物的高低来判断!如果你担心的话,最好是去大医院的肿瘤科看下,结合其他的相关检查来判定!单纯从这个一项升高这么一点是不能断定的!
爱欧尼亚荒原
你好,宫颈癌的危害表现:1 身体变化:宫颈癌可直接导致女性腹和盆部酸痛,阴道出血和恶臭白带。2 对性生活的影响:3 对子宫造成致命损伤 4 宫颈炎造成的“有菌”白带和阴道碱环境不利精子的生存和游动。宫颈炎也是流产的一个病因,宫颈炎使组织变化,弹性下降,会使产程不顺利;严重的宫颈炎还会影响性生活。5 长期威胁心理健康 宫颈癌早期症状:原位癌及早期浸润癌常无任何症状,子宫颈癌的主要症状是阴道流血、阴道分泌物增多和疼痛等。其表现的形式和程度与子宫颈癌病变的早晚及病理类型有一定的关系
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如果SCC升高的话,需要排除是否有复发的可能的。 你好!宫颈癌是妇科恶性的肿瘤,如果明确的话,是要及时的治疗的,首选的治疗是手术,术后配合放化疗治疗,防止复发和转移,如果SCC升高的话,需要排除是否有复发的可能的。 SCC中文称为鳞状上皮细胞癌抗原,是判断癌症的重要依据之一。血清中SCC水平升高,可见于83%的宫颈癌。临床上常用于监测上述恶性肿瘤的治疗效果、复发、转移或评价预后。SCC升高一定要提高警惕。如果SCC持续升高往往有病灶存在。意见建议:建议你:需要进一步的检查和明确的,如果轻度升高话,可以过段时间复查一下,如果持续升高的话,需要考虑放化疗的。家属要宽舒患者的心理状态,做好心理治疗,增加饮食营养,提高自身免疫功能
【病史摘要】男性,68岁。进行性吞咽困难3个月余。 【CT征象】平扫见食管中段管壁明显增厚,最厚处可达1.4cm,食管管壁不规则,食管与主动脉及心脏后缘的脂肪间
临床中我们不时的见到犬、猫口腔长了或大或小的肿块,有的甚至长于多处,影响犬猫食欲、厌食、咀嚼困难、还会出血不止…,严重降低了犬猫的生活质量,这让宠物及其主人痛苦
鳞状细胞癌可表现角化、角化珠形成和/或细胞间桥等特征。这些特征随分化程度而表现不同。在分化良好的肿瘤中该特征表现明显,而在分化差的肿瘤中仅局部可见。乳头状型SC
中医的疗效不能肯定,不建议你使用!做过病理了吗?如果确诊了,还是到医院积极治疗!<"喉咽"鳞状细胞癌可以肯定不是病理诊断>
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