计算机辅助抗癌药物设计和蛋白同源建模研究.【摘要】：传统的药物设计方法耗时耗力,具有一定的随机性和盲目性,缺乏应有的合理性。.随着自动化平台、计算化学、以及生物学的快速发展,基于计算机辅助的药物设计已逐渐成为重要的技术手段之一。.本学位...
【摘要】：蛋白质大分子的三维结构决定了蛋白质的功能与性质,蛋白质结构预测在医学、药物学、生物学等研究中均具有重要的意义。同源建模法是目前唯一在实际中应用的蛋白质分子结构的预测方法。研究表明,蛋白质中氨基酸序列的一级结构决定着三维结构,序列相似的蛋白质可能起源于共同的...
蛋白质同源建模对于高级结构未知蛋白的功能预测具有重要意义。.同源模型的构建是基于特定的程序进行的，大量及时更新的序列和丰富的蛋白结构数据库是基础。.将需要的工具、程序及数据库整合而成一个基于互联网的工作站，有利于广大科研工作者借助...
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蛋白同源建模及分子对接总结.ppt,原理：原子能量最小化**蛋白同源建模及分子对接——以CueO蛋白为例基本策略建立模型：Swiss-model、Modeller模型检测：Save模型优化：Chiron再次检测：Save分子对接：Autodock序列与模板相似度，>30...
在做分子对接时，如果没有蛋白质的三维结构，一般通过同源建模得到所需蛋白质的三维结构。现在想和各位虫虫们讨论一下：是在swiss-model上面下载上面自动建模得到的蛋白质好呢，还是自己同源建模得到的三维结构比较好？请各位各抒己见，好让我们这些比较晚接触这方面的有所取舍。
貌似很多人都对同源建模的优化感到困惑，我也一样。.今天上午跟老板一起讨论下这个问题（因为读博刚进实验室没多久，所以经验不一定很多，所以这里只是和大家一起分享下我们实验室的经验），感觉收获很多。.一般在同源建模的时候，初始的模型是非常...
同源建模通常要求模板蛋白与目标蛋白的序列一致性高于30%。同源建模的步骤同源建模可以通过以下7个步骤进行[1]：1、搜索结构模型的模板(T)。同源建模方法假设两个同源的蛋白质具有相同…
根据DeepMind公开的论文《Improvedproteinstructurepredictionusingpredictedinter-residueorientations》。AlphaFold由深度学习和传统算法混合而成：CNN+Rosetta。具体来说构建神经网络预测残基间的方向和距离，然后用Rosetta对蛋白质结构同源建模
蛋白同源建模及分子对接——以CueO蛋白为例序列与模板相似度，>30%模板可用GMQE（GlobalModelQualityEstimation）是一种基于目标模板对准结合性质的质量估计，数值在0-1之间，越接近于1表示模型越接近实验结果。
求助全文通过文献互助平台发起求助,成功后即可免费获取论文全文。您可以选择微信扫码或财富值支付求助。我要求助相似文献褐虾过敏原crac8蛋白的结构分析和同源建模为了...
二、使用modeller对目的蛋白序列同源建模>p1:dfra12MNSESVRIYLVAAMGANRVIGNGPNIPWKIPGEQKIFRRLTEGKVVVMGRKTFESIGKPLPNRHTLVISRQANYRATGCVVVSTLSHAIALASELGNELYVAGGAEIYTLALPHAHGV...
我正在学习做同源建模，目标序列比对时，前半部分氨基酸与工A蛋白有较高的相似性，而后半部分氨基酸与B...
预测分为从头预测和同源建模。同源建模预测的准确度高于从头预测,尽管依然没有真实测定来的准确。通过对预测结构的分析,是可以获得很多信息的,比如解释酶的催化机理或者预测蛋白质的...
蛋白质分子结构测定-化学中心首页星级:7页暂无目录点击鼠标右键菜单,创建目录暂无笔记选择文本,点击鼠标右键菜单,添加笔记暂无书签在左侧文档中,...
学硕士学位论文哈尔滨工业大学工学硕士学位论文--I-摘要获取蛋白质的结构和功能是生物学研究的重要目的之一,但是使用X光晶体衍射和核磁共振技术等实验...
蛋白质同源建模对于高级结构未知蛋白的功能预测具有重要意义。同源模型的构建是基于特定的程序进行的,大量及时更新的序列和丰富的蛋白结构数据库是基础。将需要...
蛋白同源建模及分子对接演讲稿.ppt,Modeller软件Modeller是一种用Python语言编写的,可用于本地建立分子模型的软件。然而,很多人并不熟悉Python语言,因此有人编...
时间:2010-10-1808:48:29数理化学论文我要投稿基于同源建模的蛋白质结构预测方法的研究针对profile-profile方法中profile中出现的数据稀疏问题所采用的数...
·蛋白质序列的相似性第16页·序列的两两比对第16-19页·常用分数矩阵第19-21页·蛋白质的结构第21-22页·同源建模的蛋白质结构预测过程第22-27页·实...