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下面，我们一起来看一下如何绘制基因突变后氨基酸位点的Lollipop图。.1.TCGA突变数据的下载.对于TCGA数据库中数据的下载，我们使用R的TCGAbiolinks包的GDCquery_Maf()函数来进行下载。.与之前的一样，在此我们还是选择varscan2类型的数据进行下载。.提取突变数据中...
原创huacishu图灵基因昨天收录于话题#前沿生物大数据分析撰文：huacishuIF=47.724推荐度：⭐⭐⭐⭐⭐亮点：1、该研究中作者利用蛋白质组学质谱和数据整合，构建出人类癌细胞中发现的蛋白组装体（proteinassemblies）的结构化图谱。；2、随后作者开发出一种突变的统计模型，精确指出…
通过与已发表文献的比较，我们发现此例对联合治疗不敏感可能与存在CTNNB1第3外显子共突变有关，并根据基因...近三年以第一、通讯作者发表SCI论文13篇2018,2019,2020连续三年衢州市卫生系统自然科学论文一等奖上一篇...
SCI发表模板丨新颖的焦亡相关基因，常规的预后模型套路巧发5分+SCI大家好！今天跟大家分享的文献时2021年4月发表在CellDeathDiscovery（IF=5.241）杂志上的一篇文献。文章利用TCGA队列和GEO队列构建了一个用于预测OC的7-焦亡相关基因风险模型。
基因之间是否存在并发或互斥的突变。基因共表达分析。查询基因与突变频率最高的基因中连接最多的50个基因之间的互作网络。包含查询的基因突变的病人和其它病人之间的生存分析比较。FireBrowse|BROAD开发的TCGA分析平台，强大的下载功能特定基因
文章基本信息.分享2019年12月发表在CellProliferation杂志的一篇论著文章，全文使用网络在线数据库进行研究。.2019年影响因子刚好5分。.杂志的影响因子趋势，2018年就接近5分了，2019年5分，似乎还是很靠谱的吧。.(注：影响因子查询来源于GeenMedical网站)
本文分享自微信公众号-芒果先生聊生信（gh_17550483192a），作者：芒果Mango原文出处及转载信息见文内详细说明，如有侵权，请联系yunjia_community@tencent删除。原始发表时间：2020-08-03本文参与腾讯云自媒体分享计划，欢迎正在阅读的你也加入，一起分享。
单基因SCI套路必备必备！.多组学，临床统计，掌握这一个数据库就够了！.一文学会cBioPortal数据库使用方法.大家好，我是弘毅。.上回说到，TCGA家族好兄弟TCIA(TheCancerImmunomeAtlas)数据库的使用方法，想必不少小伙伴已是摩拳擦掌跃跃欲试，甚至于已经SCI论文...
SCI论文（scipaper.net）:摘要：目的通过对临床上符合马凡氏综合征（MFS）临床诊断的进行分析并提供客观实验室依据，并对MFS家系进行FBN1基因突变筛查，希望发现这个家族的致病基因突变和基因突变位点，并探寻该家系的分子发病机制。.方法收集MFS...
Science：干饭人的福音！.控制体重的基因密码终于被找到！.就在近日，再生元遗传学中心联合纽约医学院、杜克大学、宾夕法尼亚大学等高校的研究人员共同在Science发布了一篇题为：Sequencingof640,000exomesidentifiesGPR75variantsassociatedwithprotectionfromobesity的...
近日,刊登在国际著名杂志Science上的一篇研究论文中,来自华盛顿大学的研究人员通过研究表示,不同种族个体之间的遗传差异或许主要取决于名为基因拷贝数变异(CNVs...
近日,来自中国、英国和等国的科学家在Nature期刊发表了4篇论文,反向推算出人体从受精卵到成人的发育过程,而他们借助的是每个细胞中特有的指纹——特有的基...
基因组可视化数据做图(突变分布图)已有1人参与想咨询下,这个图是用什么包画的?没找到诶,有哪位好心人告知一下...普通表情龙兔虎猫高级回复(可上传附件)...
今天跟大家分享的文献是2020年9月发表在MolecularTherapy-Oncolytics(IF=4.115)杂志上的一篇文章。文章利用TGCA数据库中肺癌的转录组数据,使用代谢基因特征建立预测模型,预测...
学完老大GEO课程复现SCI文章差异基因的热图复现这篇文献里的一幅热图Tinagl1SuppressesTriple-NegativeBreastCancerProgressionandMetastasisbySimultaneouslyIn...
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今天跟大家分享的文献是2020年9月发表在MolecularTherapy-Oncolytics(IF=4.115)杂志上的一篇文章。文章利用TGCA数据库中肺癌的转录组数据,使用代谢基因特...
文献1:眼中葡萄膜黑色素恶性瘤基因共表达网络分析眼癌中共表达网络分析及关键biomarker查找主要的分析思路其实就是WGCNA的分析思路:分析套路文献2:胃癌中mi...
769个癌症关键基因.(来自:MedSci医学APP)随梦飞扬于2017-10-31评论道:具有生物标志物的80%以上的依赖性与基因表达的变化有关(上调或下调)。突变(通常是支...
我们根据队列1中的突变谱(图1A)进行了生存分析。队列1中最常见的基因共突变是TP53(n=43,47.3%)、CTNNB1(n=7,9.3%)、PIK3CA(n=6,8.0%)和RB1(n=5,6.7%)...